163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0677 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  76.41 
 
 		 793 aa  1268    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  46.71 
 
 		 785 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  59.57 
 
 		 788 aa  965    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  53.17 
 
 		 805 aa  843    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  100 
 
 		 796 aa  1631    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  79.02 
 
 		 790 aa  1297    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  43.19 
 
 		 835 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  40.18 
 
 		 789 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  40 
 
 		 789 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  40.58 
 
 		 830 aa  572  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  40.83 
 
 		 822 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  40.94 
 
 		 821 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  38.23 
 
 		 829 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.58 
 
 		 826 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  39.56 
 
 		 823 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  39.44 
 
 		 822 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  38.96 
 
 		 826 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  38.96 
 
 		 826 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  37.42 
 
 		 800 aa  541  9.999999999999999e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  39.95 
 
 		 816 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  38.4 
 
 		 831 aa  536  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  37.42 
 
 		 800 aa  538  1e-151  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  37.04 
 
 		 815 aa  538  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  38.4 
 
 		 831 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  37.59 
 
 		 830 aa  509  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  36.35 
 
 		 801 aa  505  1e-141  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  34.88 
 
 		 803 aa  493  9.999999999999999e-139  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.9 
 
 		 804 aa  487  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  36.93 
 
 		 839 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.16 
 
 		 805 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.36 
 
 		 803 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  34.46 
 
 		 797 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.11 
 
 		 819 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  35.24 
 
 		 819 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  31.2 
 
 		 915 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  31.41 
 
 		 924 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  31.19 
 
 		 876 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  30.21 
 
 		 922 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  30.42 
 
 		 915 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  30.48 
 
 		 826 aa  353  8e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  30.17 
 
 		 804 aa  348  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  30.2 
 
 		 849 aa  343  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  30.08 
 
 		 826 aa  339  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  28.84 
 
 		 916 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  28.75 
 
 		 792 aa  303  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  28.66 
 
 		 752 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  33.39 
 
 		 561 aa  288  4e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  29.34 
 
 		 791 aa  263  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  28.61 
 
 		 791 aa  260  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.66 
 
 		 787 aa  260  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  24.84 
 
 		 788 aa  258  2e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.44 
 
 		 857 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  25.12 
 
 		 830 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  26.49 
 
 		 808 aa  213  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  22.1 
 
 		 791 aa  210  7e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  25.63 
 
 		 821 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  26.04 
 
 		 814 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  25.77 
 
 		 812 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  25.22 
 
 		 872 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  23.71 
 
 		 810 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  25.42 
 
 		 809 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  24.88 
 
 		 813 aa  201  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  25.03 
 
 		 813 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  24.21 
 
 		 824 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  22.88 
 
 		 791 aa  197  9e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  25.5 
 
 		 820 aa  197  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  23.7 
 
 		 841 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  24.94 
 
 		 813 aa  196  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  23.97 
 
 		 812 aa  196  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  25.31 
 
 		 812 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  24.78 
 
 		 813 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  24.88 
 
 		 809 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  26.3 
 
 		 877 aa  194  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  25.96 
 
 		 816 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  25.96 
 
 		 816 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  24.18 
 
 		 812 aa  194  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  24.68 
 
 		 817 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  25.56 
 
 		 822 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  24.54 
 
 		 813 aa  192  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  26.02 
 
 		 812 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  25.75 
 
 		 836 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  24.34 
 
 		 816 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  25.15 
 
 		 836 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  24.08 
 
 		 816 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  24.6 
 
 		 847 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.37 
 
 		 846 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  24.21 
 
 		 819 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  24.66 
 
 		 813 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  26.13 
 
 		 687 aa  187  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  24.84 
 
 		 829 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  25.34 
 
 		 818 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.2 
 
 		 844 aa  185  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  26.02 
 
 		 840 aa  185  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  25 
 
 		 811 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  24.59 
 
 		 811 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.18 
 
 		 840 aa  184  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.18 
 
 		 840 aa  184  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  24.36 
 
 		 812 aa  184  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  24.33 
 
 		 822 aa  184  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  24.33 
 
 		 812 aa  183  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>