145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1041 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  79.65 
 
 
791 aa  1358    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  100 
 
 
791 aa  1640    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  41.78 
 
 
788 aa  624  1e-177  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  25.96 
 
 
800 aa  292  1e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  26.34 
 
 
801 aa  291  3e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  26.2 
 
 
800 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  26.36 
 
 
803 aa  281  4e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.29 
 
 
804 aa  233  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  24.32 
 
 
819 aa  231  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.96 
 
 
805 aa  228  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.41 
 
 
819 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.65 
 
 
793 aa  224  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.32 
 
 
803 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.22 
 
 
785 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  22.28 
 
 
788 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  22.51 
 
 
835 aa  205  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.45 
 
 
805 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.62 
 
 
790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.88 
 
 
796 aa  197  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  21.31 
 
 
815 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  24.47 
 
 
839 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.53 
 
 
826 aa  191  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.53 
 
 
826 aa  191  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.32 
 
 
826 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  21.55 
 
 
822 aa  185  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  22.35 
 
 
830 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0766  type IV secretion system protein VirB4  24.22 
 
 
750 aa  180  8e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  21.75 
 
 
823 aa  180  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  21.09 
 
 
831 aa  173  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  21.69 
 
 
822 aa  173  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.49 
 
 
829 aa  172  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  20.97 
 
 
831 aa  170  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  23.11 
 
 
816 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  21.13 
 
 
821 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  20.81 
 
 
797 aa  155  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.76 
 
 
830 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  23.6 
 
 
826 aa  144  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  22.66 
 
 
826 aa  137  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  20.54 
 
 
849 aa  134  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  20.73 
 
 
789 aa  131  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  18.99 
 
 
789 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  20.54 
 
 
876 aa  124  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  20.33 
 
 
804 aa  122  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  20.92 
 
 
924 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  19.73 
 
 
915 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  19.87 
 
 
922 aa  112  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  22.69 
 
 
791 aa  110  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  24.22 
 
 
824 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  19.86 
 
 
915 aa  107  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.87 
 
 
791 aa  107  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  20.93 
 
 
561 aa  104  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.19 
 
 
787 aa  104  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  19.62 
 
 
752 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  24.44 
 
 
813 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  25.06 
 
 
816 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  25.06 
 
 
816 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.43 
 
 
850 aa  101  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  24.43 
 
 
812 aa  100  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  24.66 
 
 
812 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  25.84 
 
 
812 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  23.61 
 
 
836 aa  97.8  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  23.11 
 
 
814 aa  96.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.71 
 
 
843 aa  97.4  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  22.38 
 
 
820 aa  96.3  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  23.58 
 
 
808 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  25.45 
 
 
812 aa  95.9  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  25.15 
 
 
830 aa  95.9  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  25.15 
 
 
812 aa  95.5  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  23.15 
 
 
808 aa  94.4  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  24.48 
 
 
836 aa  94.4  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  21.23 
 
 
816 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.12 
 
 
850 aa  93.6  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  22.95 
 
 
814 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  23.79 
 
 
821 aa  92.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  21.23 
 
 
816 aa  92  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  25.46 
 
 
809 aa  92  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  24.16 
 
 
822 aa  91.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  21.2 
 
 
816 aa  91.3  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  25.07 
 
 
847 aa  91.3  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  20.16 
 
 
916 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  23.83 
 
 
820 aa  91.3  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  23.79 
 
 
812 aa  90.9  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  24.8 
 
 
812 aa  90.9  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  22.25 
 
 
819 aa  90.9  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  23.78 
 
 
813 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  21.79 
 
 
810 aa  90.5  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  24.35 
 
 
812 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  23.93 
 
 
872 aa  89.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  24.77 
 
 
877 aa  89.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  21.02 
 
 
825 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  24.07 
 
 
811 aa  89  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  23.68 
 
 
818 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  20.51 
 
 
816 aa  88.6  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  22 
 
 
811 aa  87.8  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  22.76 
 
 
823 aa  87.8  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  21.7 
 
 
845 aa  87.4  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  21.61 
 
 
817 aa  87.4  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  21.14 
 
 
819 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  20.16 
 
 
813 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  24.84 
 
 
813 aa  86.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>