173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0315 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  75.84 
 
 
812 aa  1218    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  62.08 
 
 
816 aa  993    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  74.63 
 
 
812 aa  1236    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  75.62 
 
 
808 aa  1193    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  61.81 
 
 
825 aa  993    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  59.66 
 
 
813 aa  913    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  51.79 
 
 
819 aa  751    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  61.31 
 
 
819 aa  996    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  50.61 
 
 
824 aa  793    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  100 
 
 
821 aa  1655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  72.39 
 
 
813 aa  1174    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  74.63 
 
 
813 aa  1199    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  62.83 
 
 
817 aa  980    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  48.71 
 
 
820 aa  743    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  61.71 
 
 
819 aa  995    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  61.82 
 
 
809 aa  969    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  77.96 
 
 
814 aa  1244    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  78.86 
 
 
829 aa  1274    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  53.91 
 
 
810 aa  874    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  74.47 
 
 
812 aa  1163    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  74.56 
 
 
811 aa  1176    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  74.44 
 
 
830 aa  1215    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  61.83 
 
 
816 aa  994    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  62.18 
 
 
817 aa  979    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  75.47 
 
 
812 aa  1228    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  72.85 
 
 
818 aa  1176    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  61.96 
 
 
816 aa  993    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  73.23 
 
 
872 aa  1189    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  72.23 
 
 
836 aa  1157    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  73.72 
 
 
877 aa  1176    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  62.08 
 
 
816 aa  946    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  61.25 
 
 
813 aa  994    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  65.84 
 
 
812 aa  1070    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  61.39 
 
 
811 aa  989    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  72.37 
 
 
813 aa  1169    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  61.74 
 
 
823 aa  974    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  61.96 
 
 
816 aa  999    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  47.41 
 
 
819 aa  679    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  72.8 
 
 
813 aa  1197    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  72.92 
 
 
814 aa  1214    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  76.03 
 
 
809 aa  1252    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  74.84 
 
 
812 aa  1201    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  62.33 
 
 
816 aa  996    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  62.3 
 
 
817 aa  995    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  66.91 
 
 
822 aa  1058    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  81.27 
 
 
820 aa  1304    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  61.99 
 
 
823 aa  977    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  61.57 
 
 
817 aa  956    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  72.6 
 
 
836 aa  1166    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  73.1 
 
 
816 aa  1185    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  61.44 
 
 
808 aa  956    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  73.1 
 
 
816 aa  1185    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  74.94 
 
 
809 aa  1228    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  73.1 
 
 
847 aa  1192    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  73.85 
 
 
812 aa  1193    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  74.84 
 
 
812 aa  1201    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  76.09 
 
 
812 aa  1254    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  41.14 
 
 
819 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  40.99 
 
 
817 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  40.07 
 
 
822 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  40.17 
 
 
817 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  38.91 
 
 
815 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  39.95 
 
 
820 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  39.28 
 
 
840 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  39.28 
 
 
840 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  42.01 
 
 
814 aa  558  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  38.92 
 
 
840 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2098  conjugal transfer protein trbE  75.2 
 
 
401 aa  538  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  38.55 
 
 
852 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  38.55 
 
 
852 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  38.91 
 
 
852 aa  529  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  37.16 
 
 
845 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  36.91 
 
 
854 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  40.58 
 
 
687 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  30.94 
 
 
843 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  31.74 
 
 
850 aa  437  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4692  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  32.32 
 
 
808 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0805  conjugal transfer protein  72.69 
 
 
258 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.86 
 
 
827 aa  260  8e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.56 
 
 
846 aa  257  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.06 
 
 
844 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.93 
 
 
793 aa  212  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.58 
 
 
790 aa  211  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.63 
 
 
796 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  27.61 
 
 
803 aa  203  9e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  26.31 
 
 
788 aa  196  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  24.87 
 
 
800 aa  195  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  24.97 
 
 
800 aa  194  6e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  24.63 
 
 
818 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.76 
 
 
805 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.79 
 
 
815 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.28 
 
 
825 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.15 
 
 
850 aa  183  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  29.83 
 
 
831 aa  180  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  31.84 
 
 
801 aa  176  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.84 
 
 
821 aa  171  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2097  type IV secretion system protein VirB4  65.89 
 
 
156 aa  171  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.07 
 
 
825 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.52 
 
 
804 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.81 
 
 
785 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851787 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>