150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7347 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  100 
 
 		 849 aa  1754    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.73 
 
 		 793 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  31.64 
 
 		 788 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.9 
 
 		 829 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.86 
 
 		 805 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  29.86 
 
 		 831 aa  365  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  29.63 
 
 		 831 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  30.06 
 
 		 830 aa  363  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.65 
 
 		 826 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.65 
 
 		 826 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.92 
 
 		 826 aa  360  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  30.13 
 
 		 835 aa  358  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  29.98 
 
 		 822 aa  356  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.75 
 
 		 790 aa  352  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  29.81 
 
 		 821 aa  348  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  29.61 
 
 		 822 aa  347  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  29.69 
 
 		 815 aa  347  8e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.15 
 
 		 830 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  30.54 
 
 		 816 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.2 
 
 		 796 aa  343  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.05 
 
 		 804 aa  341  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  29.56 
 
 		 823 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.09 
 
 		 785 aa  336  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.55 
 
 		 805 aa  331  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.8 
 
 		 819 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  28.89 
 
 		 801 aa  327  8.000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  27.58 
 
 		 800 aa  326  1e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  28.54 
 
 		 819 aa  322  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  27.46 
 
 		 800 aa  320  9e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.57 
 
 		 803 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  28.51 
 
 		 803 aa  311  2e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  28.41 
 
 		 839 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.38 
 
 		 915 aa  266  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  25.38 
 
 		 915 aa  263  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  26.3 
 
 		 916 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  26.7 
 
 		 876 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  26.93 
 
 		 924 aa  249  1e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  25.76 
 
 		 797 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  25.51 
 
 		 752 aa  240  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  26.28 
 
 		 789 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  25.53 
 
 		 789 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  24.17 
 
 		 922 aa  223  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  25.12 
 
 		 804 aa  223  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  24.1 
 
 		 792 aa  211  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  23.02 
 
 		 826 aa  199  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  22.91 
 
 		 826 aa  199  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  25.52 
 
 		 561 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.43 
 
 		 857 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  24.06 
 
 		 791 aa  165  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.92 
 
 		 787 aa  164  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.27 
 
 		 791 aa  158  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  20.68 
 
 		 791 aa  141  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  20.54 
 
 		 791 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  21.86 
 
 		 841 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  19.79 
 
 		 788 aa  115  5e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  23.54 
 
 		 808 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  20.74 
 
 		 843 aa  99.4  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.77 
 
 		 827 aa  91.3  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  26.15 
 
 		 819 aa  91.3  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  20.86 
 
 		 815 aa  87.8  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.03 
 
 		 821 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  22.91 
 
 		 836 aa  85.1  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  23.75 
 
 		 822 aa  84.3  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  23.28 
 
 		 812 aa  84  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  22.61 
 
 		 687 aa  83.2  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.14 
 
 		 846 aa  81.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  23.11 
 
 		 812 aa  80.9  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  22.1 
 
 		 813 aa  80.5  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  21.9 
 
 		 817 aa  80.1  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  22.35 
 
 		 821 aa  78.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  22.43 
 
 		 812 aa  78.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  22.86 
 
 		 836 aa  78.2  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  23.2 
 
 		 810 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  23.88 
 
 		 812 aa  77.4  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  22.51 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  23.03 
 
 		 813 aa  75.5  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  21.89 
 
 		 847 aa  75.5  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  24.44 
 
 		 812 aa  75.5  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  25.39 
 
 		 816 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  25.39 
 
 		 816 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  25.08 
 
 		 823 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  21.75 
 
 		 813 aa  74.7  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  22.07 
 
 		 872 aa  74.7  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  21.12 
 
 		 817 aa  74.3  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  21.25 
 
 		 814 aa  74.3  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  25.65 
 
 		 819 aa  73.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  22.2 
 
 		 814 aa  73.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  20.96 
 
 		 830 aa  73.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.23 
 
 		 844 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  24.77 
 
 		 823 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  21.74 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  24.15 
 
 		 808 aa  73.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  21.19 
 
 		 809 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  25.61 
 
 		 817 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  23.56 
 
 		 811 aa  72.8  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  26.06 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  19.46 
 
 		 850 aa  72  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  22.16 
 
 		 812 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  25.91 
 
 		 816 aa  72  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  23.96 
 
 		 877 aa  72  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>