155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6325 on replicon NC_010509
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  72.62 
 
 		 831 aa  1299    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  100 
 
 		 829 aa  1739    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  42.42 
 
 		 830 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  47.79 
 
 		 826 aa  772    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  49.14 
 
 		 830 aa  806    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  49.88 
 
 		 822 aa  821    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  48.85 
 
 		 823 aa  801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  48.14 
 
 		 826 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  49.1 
 
 		 822 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  48.14 
 
 		 826 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  72.38 
 
 		 831 aa  1294    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  48.11 
 
 		 821 aa  791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  41.08 
 
 		 816 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  39.68 
 
 		 815 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.85 
 
 		 805 aa  588  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  38.95 
 
 		 793 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  38.72 
 
 		 922 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  36.32 
 
 		 915 aa  562  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  38.23 
 
 		 796 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  38.08 
 
 		 788 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.83 
 
 		 790 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  37.24 
 
 		 924 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  37.21 
 
 		 835 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  34.21 
 
 		 915 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  34.38 
 
 		 876 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  32.89 
 
 		 916 aa  469  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  33 
 
 		 805 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.48 
 
 		 785 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.57 
 
 		 819 aa  439  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.53 
 
 		 803 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  32.85 
 
 		 819 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  32.37 
 
 		 800 aa  422  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.47 
 
 		 804 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  31.17 
 
 		 800 aa  414  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  32.26 
 
 		 803 aa  412  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  30.49 
 
 		 789 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  32.7 
 
 		 839 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  30.69 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  31.82 
 
 		 789 aa  405  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  40.18 
 
 		 561 aa  405  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  29.66 
 
 		 849 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  28.75 
 
 		 797 aa  348  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  29.69 
 
 		 804 aa  345  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  27.82 
 
 		 826 aa  325  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  27.58 
 
 		 826 aa  319  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  29 
 
 		 752 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  27.73 
 
 		 792 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.13 
 
 		 791 aa  242  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.63 
 
 		 787 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  25.81 
 
 		 791 aa  233  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.88 
 
 		 857 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  23.09 
 
 		 841 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  22.09 
 
 		 788 aa  205  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  20.86 
 
 		 791 aa  183  9.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  20.49 
 
 		 791 aa  172  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  25 
 
 		 687 aa  160  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  21.92 
 
 		 824 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.39 
 
 		 846 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  23.78 
 
 		 817 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  22.46 
 
 		 816 aa  137  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  22.84 
 
 		 823 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  22.96 
 
 		 813 aa  135  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  21.63 
 
 		 819 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  22.97 
 
 		 823 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  22.4 
 
 		 816 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  23.14 
 
 		 815 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  21.24 
 
 		 810 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  22.88 
 
 		 813 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  22.07 
 
 		 809 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  22.53 
 
 		 811 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  22.22 
 
 		 819 aa  132  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  23.04 
 
 		 817 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.05 
 
 		 844 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  21.95 
 
 		 825 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  21.25 
 
 		 817 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  21.6 
 
 		 817 aa  127  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  22.09 
 
 		 816 aa  127  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  22.09 
 
 		 816 aa  127  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  22.01 
 
 		 808 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.79 
 
 		 840 aa  124  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.79 
 
 		 840 aa  124  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.79 
 
 		 850 aa  124  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  21.82 
 
 		 817 aa  124  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  21.79 
 
 		 816 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  22.3 
 
 		 813 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  21.72 
 
 		 854 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  23.07 
 
 		 819 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  23.73 
 
 		 845 aa  122  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  22.95 
 
 		 813 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.27 
 
 		 850 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  22 
 
 		 830 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.74 
 
 		 843 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  25.69 
 
 		 840 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21 
 
 		 827 aa  117  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  21.89 
 
 		 821 aa  117  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  22.91 
 
 		 822 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  21.71 
 
 		 852 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  21.71 
 
 		 852 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  21.41 
 
 		 852 aa  115  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  22.05 
 
 		 819 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>