167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4851 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  47.4 
 
 		 831 aa  743    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  77.98 
 
 		 822 aa  1313    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  76.87 
 
 		 830 aa  1280    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  78.02 
 
 		 822 aa  1271    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  77.67 
 
 		 823 aa  1315    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  100 
 
 		 826 aa  1704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  100 
 
 		 826 aa  1704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  49.87 
 
 		 830 aa  741    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  98.06 
 
 		 826 aa  1674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  48.14 
 
 		 829 aa  771    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  47.28 
 
 		 831 aa  737    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  44.18 
 
 		 815 aa  681    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  75.82 
 
 		 821 aa  1282    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  43.56 
 
 		 816 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  41.03 
 
 		 788 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  40.54 
 
 		 793 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  40.12 
 
 		 835 aa  568  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.48 
 
 		 790 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.63 
 
 		 805 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  38.96 
 
 		 796 aa  548  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  34.22 
 
 		 915 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.28 
 
 		 785 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  33.92 
 
 		 924 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.92 
 
 		 803 aa  459  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  34.48 
 
 		 915 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.3 
 
 		 804 aa  452  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.48 
 
 		 819 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.43 
 
 		 805 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  32.72 
 
 		 800 aa  439  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  32.92 
 
 		 800 aa  438  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  32.55 
 
 		 801 aa  430  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  33.92 
 
 		 819 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  31.94 
 
 		 922 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  32.8 
 
 		 916 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  32.62 
 
 		 803 aa  423  1e-117  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  33.42 
 
 		 789 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  32.93 
 
 		 876 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  32.78 
 
 		 789 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  32.92 
 
 		 839 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  31.04 
 
 		 797 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  29.19 
 
 		 849 aa  357  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  30.43 
 
 		 804 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  37.59 
 
 		 561 aa  344  4e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  31.13 
 
 		 752 aa  343  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  28.94 
 
 		 792 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  27.51 
 
 		 826 aa  320  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  27.25 
 
 		 826 aa  310  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.33 
 
 		 857 aa  301  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.71 
 
 		 791 aa  269  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.36 
 
 		 787 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  27.59 
 
 		 791 aa  262  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  24.02 
 
 		 841 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  20.44 
 
 		 788 aa  198  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  23.53 
 
 		 791 aa  191  7e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  20.5 
 
 		 791 aa  178  4e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  27.24 
 
 		 813 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  23.88 
 
 		 816 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  25.58 
 
 		 824 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  23.33 
 
 		 816 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  23.27 
 
 		 813 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.3 
 
 		 816 aa  125  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  23.75 
 
 		 819 aa  125  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  29 
 
 		 812 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  23.46 
 
 		 809 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  27.18 
 
 		 823 aa  123  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  23.57 
 
 		 816 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  23.04 
 
 		 816 aa  122  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  26.99 
 
 		 823 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  24.39 
 
 		 808 aa  122  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  23.3 
 
 		 811 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  22.75 
 
 		 819 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  22.15 
 
 		 810 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  22.76 
 
 		 817 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  20.69 
 
 		 843 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  25.32 
 
 		 817 aa  116  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  23.07 
 
 		 819 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  23.32 
 
 		 817 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  26.45 
 
 		 816 aa  115  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  23.38 
 
 		 687 aa  114  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  25.29 
 
 		 817 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.24 
 
 		 827 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  22.98 
 
 		 809 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.16 
 
 		 825 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.21 
 
 		 844 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  22.93 
 
 		 815 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  24.41 
 
 		 820 aa  108  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  26.11 
 
 		 830 aa  108  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  25.44 
 
 		 825 aa  107  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  26.02 
 
 		 829 aa  107  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.18 
 
 		 831 aa  106  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  24.96 
 
 		 819 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  26.03 
 
 		 836 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  25.45 
 
 		 819 aa  106  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  25.7 
 
 		 820 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  25.3 
 
 		 813 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  20.43 
 
 		 850 aa  105  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  22.83 
 
 		 813 aa  104  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.95 
 
 		 850 aa  103  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  24.24 
 
 		 840 aa  103  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.54 
 
 		 840 aa  103  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>