179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1898 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  62.12 
 
 		 847 aa  998    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  88.62 
 
 		 816 aa  1473    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  96.2 
 
 		 817 aa  1586    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  92.43 
 
 		 819 aa  1537    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  90.09 
 
 		 816 aa  1495    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  90.45 
 
 		 816 aa  1499    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  60.99 
 
 		 809 aa  992    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  60.92 
 
 		 812 aa  984    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  58.81 
 
 		 812 aa  933    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  62.83 
 
 		 821 aa  1003    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  60.74 
 
 		 813 aa  953    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  61.3 
 
 		 813 aa  966    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  63.64 
 
 		 808 aa  988    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  100 
 
 		 817 aa  1655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  60.89 
 
 		 813 aa  947    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  94.98 
 
 		 819 aa  1582    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  94.49 
 
 		 809 aa  1545    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  60.34 
 
 		 814 aa  958    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  61.24 
 
 		 829 aa  974    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  49.26 
 
 		 820 aa  774    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  61.28 
 
 		 812 aa  937    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  61.76 
 
 		 811 aa  957    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  61.12 
 
 		 830 aa  986    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  89.84 
 
 		 816 aa  1492    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  96.82 
 
 		 817 aa  1579    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  91.86 
 
 		 823 aa  1509    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  90.7 
 
 		 816 aa  1503    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  52.92 
 
 		 819 aa  766    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  61.65 
 
 		 872 aa  976    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  60.74 
 
 		 836 aa  942    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  61.65 
 
 		 877 aa  942    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  91.39 
 
 		 816 aa  1449    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  85.87 
 
 		 813 aa  1449    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  60.42 
 
 		 818 aa  957    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  91.25 
 
 		 823 aa  1502    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  55.62 
 
 		 810 aa  926    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  61.31 
 
 		 812 aa  963    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  89.72 
 
 		 811 aa  1492    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  61.5 
 
 		 812 aa  981    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  90.18 
 
 		 825 aa  1510    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  61.41 
 
 		 812 aa  988    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  59.98 
 
 		 813 aa  939    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  52.42 
 
 		 824 aa  823    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  50 
 
 		 819 aa  741    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  60.62 
 
 		 813 aa  981    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  60.62 
 
 		 814 aa  968    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  62.22 
 
 		 809 aa  1009    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  60.94 
 
 		 812 aa  956    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  59.06 
 
 		 822 aa  932    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  61.83 
 
 		 820 aa  988    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  95.47 
 
 		 817 aa  1544    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  60.15 
 
 		 836 aa  943    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  60.82 
 
 		 812 aa  958    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  60.42 
 
 		 812 aa  967    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  60.67 
 
 		 816 aa  976    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  63.42 
 
 		 808 aa  1016    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  60.67 
 
 		 816 aa  976    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  40.7 
 
 		 815 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  41.01 
 
 		 817 aa  588  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  40.68 
 
 		 819 aa  588  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  40.67 
 
 		 822 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  43.33 
 
 		 814 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  39.93 
 
 		 817 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  39.98 
 
 		 820 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  37.59 
 
 		 852 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  37.59 
 
 		 852 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  37.5 
 
 		 854 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  37.59 
 
 		 852 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  36.65 
 
 		 845 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  37.09 
 
 		 840 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  37.09 
 
 		 840 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  37.12 
 
 		 840 aa  519  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  41.65 
 
 		 687 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4692  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  33.25 
 
 		 808 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2098  conjugal transfer protein trbE  60.8 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  32.07 
 
 		 843 aa  412  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  32.27 
 
 		 850 aa  409  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0805  conjugal transfer protein  62.95 
 
 		 258 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.85 
 
 		 827 aa  268  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  26.99 
 
 		 818 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.62 
 
 		 850 aa  223  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.3 
 
 		 846 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.03 
 
 		 844 aa  222  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.67 
 
 		 815 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  26.12 
 
 		 800 aa  216  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  26.1 
 
 		 803 aa  216  9.999999999999999e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  25.85 
 
 		 800 aa  216  9.999999999999999e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  29.88 
 
 		 801 aa  211  4e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  30.89 
 
 		 839 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.06 
 
 		 825 aa  191  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.88 
 
 		 821 aa  190  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.12 
 
 		 831 aa  188  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.82 
 
 		 803 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.28 
 
 		 790 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.52 
 
 		 793 aa  182  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.38 
 
 		 804 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.43 
 
 		 825 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.17 
 
 		 796 aa  181  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.77 
 
 		 785 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.33 
 
 		 805 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>