173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3854 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  60.84 
 
 		 816 aa  974    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  60.15 
 
 		 816 aa  972    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  61.29 
 
 		 819 aa  1001    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  64.97 
 
 		 812 aa  1062    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  59.34 
 
 		 813 aa  915    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  79.88 
 
 		 812 aa  1320    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  61.36 
 
 		 816 aa  979    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  51.55 
 
 		 824 aa  806    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  74.44 
 
 		 821 aa  1215    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  73.85 
 
 		 813 aa  1206    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  79.53 
 
 		 812 aa  1309    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  77.38 
 
 		 813 aa  1265    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  77.79 
 
 		 813 aa  1253    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  61.12 
 
 		 817 aa  968    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  74.56 
 
 		 808 aa  1190    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  52.61 
 
 		 810 aa  871    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  60.32 
 
 		 819 aa  988    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  61.51 
 
 		 809 aa  968    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  74.94 
 
 		 814 aa  1218    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  76.77 
 
 		 829 aa  1239    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  60.12 
 
 		 825 aa  979    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  78.34 
 
 		 812 aa  1246    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  79.31 
 
 		 811 aa  1282    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  100 
 
 		 830 aa  1679    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  60.49 
 
 		 816 aa  967    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  61.24 
 
 		 817 aa  971    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  51.24 
 
 		 819 aa  727    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  61.11 
 
 		 816 aa  979    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  78 
 
 		 872 aa  1275    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  76.76 
 
 		 836 aa  1244    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  77.09 
 
 		 877 aa  1258    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  59.98 
 
 		 816 aa  921    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  60.54 
 
 		 813 aa  976    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  78.84 
 
 		 818 aa  1302    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  60.07 
 
 		 811 aa  972    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  61.11 
 
 		 823 aa  969    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  48.03 
 
 		 820 aa  750    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  78.26 
 
 		 812 aa  1293    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  77.02 
 
 		 812 aa  1276    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  60.94 
 
 		 823 aa  961    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  78.84 
 
 		 812 aa  1283    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  47.66 
 
 		 819 aa  680    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  74.17 
 
 		 813 aa  1236    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  75.71 
 
 		 814 aa  1248    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  76.28 
 
 		 809 aa  1256    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  79.46 
 
 		 812 aa  1301    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  61.35 
 
 		 817 aa  984    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  64.89 
 
 		 822 aa  1024    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  76.05 
 
 		 820 aa  1256    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  60.74 
 
 		 817 aa  950    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  77.26 
 
 		 836 aa  1249    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  76.98 
 
 		 816 aa  1261    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  61.82 
 
 		 808 aa  964    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  76.98 
 
 		 816 aa  1261    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  76.24 
 
 		 809 aa  1263    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  76.42 
 
 		 847 aa  1274    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  78.71 
 
 		 812 aa  1278    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  40.71 
 
 		 819 aa  587  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2098  conjugal transfer protein trbE  77.66 
 
 		 401 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  41.46 
 
 		 817 aa  558  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  38.94 
 
 		 840 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  38.94 
 
 		 840 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  39.23 
 
 		 822 aa  545  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  38.69 
 
 		 840 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  41.19 
 
 		 814 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  39.65 
 
 		 820 aa  524  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  39.24 
 
 		 815 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  38.69 
 
 		 817 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  36.65 
 
 		 845 aa  512  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  37.09 
 
 		 854 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  37.24 
 
 		 852 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  37.24 
 
 		 852 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  37.36 
 
 		 852 aa  497  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  39.97 
 
 		 687 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  31.81 
 
 		 850 aa  438  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  31.08 
 
 		 843 aa  433  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4692  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  32.44 
 
 		 808 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0805  conjugal transfer protein  78.31 
 
 		 258 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  28.76 
 
 		 827 aa  281  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.72 
 
 		 846 aa  262  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.17 
 
 		 793 aa  225  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.3 
 
 		 790 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.37 
 
 		 844 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.12 
 
 		 796 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  25.83 
 
 		 818 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  25.09 
 
 		 788 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.88 
 
 		 850 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.49 
 
 		 831 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.42 
 
 		 815 aa  193  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2097  type IV secretion system protein VirB4  66.21 
 
 		 156 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.82 
 
 		 821 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  24.52 
 
 		 800 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  32.83 
 
 		 803 aa  182  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  24.58 
 
 		 800 aa  180  8e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  24.04 
 
 		 801 aa  176  9.999999999999999e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.49 
 
 		 805 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.34 
 
 		 825 aa  171  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.99 
 
 		 804 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5418  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.35 
 
 		 892 aa  167  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5013  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.35 
 
 		 892 aa  167  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>