173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5086 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  81.46 
 
 		 793 aa  1353    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  48.59 
 
 		 785 aa  744    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  61.75 
 
 		 788 aa  994    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  54.62 
 
 		 805 aa  881    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  79.02 
 
 		 796 aa  1308    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  100 
 
 		 790 aa  1613    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  42.33 
 
 		 835 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  40.59 
 
 		 789 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  40.15 
 
 		 789 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  41.17 
 
 		 830 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  40.65 
 
 		 822 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.73 
 
 		 826 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  40.86 
 
 		 821 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  41.42 
 
 		 816 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.48 
 
 		 826 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.48 
 
 		 826 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  39.63 
 
 		 823 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.83 
 
 		 829 aa  558  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  39.8 
 
 		 822 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  38.23 
 
 		 815 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  38.92 
 
 		 831 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  37.8 
 
 		 800 aa  541  9.999999999999999e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  38.79 
 
 		 831 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  37.16 
 
 		 800 aa  533  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  38.39 
 
 		 830 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  39.34 
 
 		 803 aa  515  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  36.43 
 
 		 801 aa  503  1e-141  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  37.53 
 
 		 804 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  37 
 
 		 805 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  35.15 
 
 		 803 aa  487  1e-136  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  34.69 
 
 		 797 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.51 
 
 		 819 aa  485  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  35.69 
 
 		 839 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  36.51 
 
 		 819 aa  469  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  30.57 
 
 		 915 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  30.29 
 
 		 924 aa  394  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  29.42 
 
 		 922 aa  382  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  30.69 
 
 		 876 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  30.25 
 
 		 915 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  30.88 
 
 		 849 aa  354  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  30.46 
 
 		 804 aa  353  8.999999999999999e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  29.51 
 
 		 826 aa  345  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  29.33 
 
 		 826 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  28.77 
 
 		 916 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  28.43 
 
 		 792 aa  300  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  27.77 
 
 		 752 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  33.46 
 
 		 561 aa  292  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.61 
 
 		 787 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  28.39 
 
 		 791 aa  264  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.91 
 
 		 791 aa  262  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.94 
 
 		 857 aa  240  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  24.12 
 
 		 788 aa  239  1e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  27.92 
 
 		 809 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  26.3 
 
 		 830 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  26.97 
 
 		 820 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  27.27 
 
 		 872 aa  216  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  23.02 
 
 		 791 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  26.87 
 
 		 813 aa  214  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  25.58 
 
 		 821 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  24.4 
 
 		 810 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  26.95 
 
 		 812 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  25.34 
 
 		 812 aa  211  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  27.15 
 
 		 813 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  27.04 
 
 		 812 aa  208  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  26.64 
 
 		 814 aa  208  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  27.73 
 
 		 808 aa  208  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  26.34 
 
 		 812 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  23.62 
 
 		 791 aa  207  8e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  25.68 
 
 		 812 aa  205  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  25.5 
 
 		 829 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  26.09 
 
 		 813 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  26.07 
 
 		 809 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  25.95 
 
 		 812 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  26.39 
 
 		 812 aa  201  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  27.5 
 
 		 877 aa  200  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  24.13 
 
 		 841 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  25.16 
 
 		 818 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  26.4 
 
 		 813 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  26.63 
 
 		 836 aa  198  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  24.39 
 
 		 824 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.2 
 
 		 850 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.71 
 
 		 843 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  26 
 
 		 836 aa  195  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  25.66 
 
 		 813 aa  195  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  25.62 
 
 		 813 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  25.89 
 
 		 812 aa  194  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.08 
 
 		 844 aa  194  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  26.19 
 
 		 808 aa  194  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  25.78 
 
 		 819 aa  194  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.61 
 
 		 827 aa  193  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  25.28 
 
 		 816 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  26.55 
 
 		 816 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  26.55 
 
 		 816 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  26.15 
 
 		 847 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  25.19 
 
 		 814 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  25.77 
 
 		 822 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  26.1 
 
 		 811 aa  191  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  25.28 
 
 		 816 aa  190  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  24.53 
 
 		 817 aa  190  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.03 
 
 		 846 aa  189  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>