181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6206 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  100 
 
 		 839 aa  1732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  43.68 
 
 		 803 aa  680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  41.83 
 
 		 819 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  41.11 
 
 		 805 aa  635  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  40.31 
 
 		 804 aa  626  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  41.86 
 
 		 819 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  39.05 
 
 		 800 aa  541  9.999999999999999e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  38.08 
 
 		 800 aa  533  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  38.62 
 
 		 801 aa  528  1e-148  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  38.22 
 
 		 803 aa  523  1e-147  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  36.29 
 
 		 788 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.93 
 
 		 796 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.56 
 
 		 790 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.84 
 
 		 805 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.58 
 
 		 793 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  35.13 
 
 		 835 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.56 
 
 		 785 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  32.33 
 
 		 831 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  34.03 
 
 		 823 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  32.33 
 
 		 831 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.7 
 
 		 829 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  33.82 
 
 		 816 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  32.92 
 
 		 830 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  33.37 
 
 		 822 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  32.43 
 
 		 821 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.92 
 
 		 826 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.92 
 
 		 826 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  32.06 
 
 		 822 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.47 
 
 		 826 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  31.6 
 
 		 815 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  30.2 
 
 		 789 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  33 
 
 		 830 aa  369  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  30.65 
 
 		 789 aa  359  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  29.18 
 
 		 826 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  28.67 
 
 		 826 aa  346  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  28 
 
 		 922 aa  343  5e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  27.57 
 
 		 915 aa  342  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  29.49 
 
 		 797 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  27.36 
 
 		 924 aa  336  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.52 
 
 		 915 aa  319  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  27.82 
 
 		 876 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  29.4 
 
 		 916 aa  295  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.41 
 
 		 849 aa  279  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  26.7 
 
 		 791 aa  273  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.47 
 
 		 787 aa  269  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.06 
 
 		 791 aa  266  8.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  31.17 
 
 		 561 aa  265  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  24.81 
 
 		 752 aa  229  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  24.97 
 
 		 804 aa  223  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  23.53 
 
 		 791 aa  219  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  24.61 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.6 
 
 		 857 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  22.59 
 
 		 788 aa  209  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.49 
 
 		 846 aa  205  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  30.38 
 
 		 816 aa  201  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  30.23 
 
 		 816 aa  200  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  30.23 
 
 		 816 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  30.96 
 
 		 813 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  29.35 
 
 		 813 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  30.23 
 
 		 816 aa  197  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  24.47 
 
 		 791 aa  195  3e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.42 
 
 		 850 aa  193  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  30.5 
 
 		 819 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  30.43 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  30.99 
 
 		 811 aa  192  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  29.42 
 
 		 816 aa  190  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  30.89 
 
 		 817 aa  190  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  29.92 
 
 		 817 aa  189  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  30.31 
 
 		 817 aa  189  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  29.65 
 
 		 819 aa  187  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  25.69 
 
 		 822 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  26.63 
 
 		 687 aa  185  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  30.81 
 
 		 816 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  29.73 
 
 		 825 aa  184  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  24.9 
 
 		 820 aa  184  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  30.31 
 
 		 817 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  28.6 
 
 		 810 aa  183  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  29.92 
 
 		 823 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  29.92 
 
 		 823 aa  181  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  30.5 
 
 		 808 aa  180  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  25.51 
 
 		 819 aa  180  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  26.86 
 
 		 813 aa  171  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  24.08 
 
 		 812 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  23.8 
 
 		 814 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.27 
 
 		 844 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  29.3 
 
 		 824 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  24.17 
 
 		 817 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.74 
 
 		 827 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  23.99 
 
 		 815 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  24.35 
 
 		 817 aa  163  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  27.08 
 
 		 830 aa  162  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  24.9 
 
 		 819 aa  161  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  27.19 
 
 		 820 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.76 
 
 		 843 aa  160  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  23.16 
 
 		 872 aa  159  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.91 
 
 		 850 aa  157  9e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  23.51 
 
 		 822 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  26.82 
 
 		 847 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  26.78 
 
 		 812 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  31.06 
 
 		 819 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>