186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4376 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  48.35 
 
 		 793 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  100 
 
 		 785 aa  1618    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  45.43 
 
 		 788 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  46.2 
 
 		 805 aa  697    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  46.71 
 
 		 796 aa  706    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  48.33 
 
 		 790 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  38.85 
 
 		 835 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  36.33 
 
 		 789 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  35.99 
 
 		 789 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.78 
 
 		 826 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  37.03 
 
 		 823 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.64 
 
 		 830 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  37 
 
 		 821 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  37.23 
 
 		 830 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.28 
 
 		 826 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.28 
 
 		 826 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  37.1 
 
 		 822 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.72 
 
 		 803 aa  469  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  36.13 
 
 		 822 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  33.33 
 
 		 800 aa  458  1e-127  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  33.21 
 
 		 800 aa  457  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.3 
 
 		 804 aa  459  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  36.48 
 
 		 816 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  32.96 
 
 		 801 aa  452  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  33.71 
 
 		 819 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.47 
 
 		 805 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  34.17 
 
 		 815 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.48 
 
 		 829 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  33.46 
 
 		 797 aa  445  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  34.24 
 
 		 819 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  32.28 
 
 		 831 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  32.62 
 
 		 803 aa  423  1e-117  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  32.56 
 
 		 839 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  32.28 
 
 		 831 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  31.77 
 
 		 915 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  27.38 
 
 		 915 aa  336  7.999999999999999e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  29.23 
 
 		 849 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  28.92 
 
 		 916 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  27.67 
 
 		 876 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  27.4 
 
 		 922 aa  324  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  27.25 
 
 		 924 aa  321  3.9999999999999996e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  27.61 
 
 		 826 aa  313  7.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  27.35 
 
 		 826 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  30.53 
 
 		 787 aa  289  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  30.45 
 
 		 791 aa  289  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  32.49 
 
 		 561 aa  278  4e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  29.24 
 
 		 791 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  27.01 
 
 		 792 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  28.2 
 
 		 804 aa  260  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  26.56 
 
 		 752 aa  229  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  22.15 
 
 		 788 aa  222  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  21.48 
 
 		 791 aa  218  4e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  22.22 
 
 		 791 aa  213  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  25.1 
 
 		 808 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.87 
 
 		 857 aa  191  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  24.06 
 
 		 816 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  24.45 
 
 		 819 aa  181  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  24.43 
 
 		 819 aa  181  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  24.16 
 
 		 816 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  24.57 
 
 		 816 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  24.8 
 
 		 816 aa  179  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  23.96 
 
 		 809 aa  177  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  25.09 
 
 		 812 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  24.39 
 
 		 811 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  23.35 
 
 		 810 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  26.67 
 
 		 817 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  24.77 
 
 		 817 aa  174  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  24.84 
 
 		 819 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  23.49 
 
 		 822 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  24.48 
 
 		 808 aa  169  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  28.31 
 
 		 687 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  23.92 
 
 		 816 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  24.09 
 
 		 823 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  24.23 
 
 		 823 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.74 
 
 		 827 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  23.13 
 
 		 813 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.7 
 
 		 843 aa  164  7e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  25.71 
 
 		 817 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  23.62 
 
 		 809 aa  163  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  23.44 
 
 		 825 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  24.58 
 
 		 817 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  25.9 
 
 		 816 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  23.61 
 
 		 813 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  23.78 
 
 		 813 aa  161  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  23.83 
 
 		 817 aa  161  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  24.11 
 
 		 813 aa  160  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  23.81 
 
 		 821 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.73 
 
 		 850 aa  160  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  22.75 
 
 		 812 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  24.23 
 
 		 840 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.7 
 
 		 840 aa  157  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.7 
 
 		 840 aa  157  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  23.95 
 
 		 829 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  24.3 
 
 		 830 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  23.57 
 
 		 814 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  27.61 
 
 		 812 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  27.56 
 
 		 815 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  23.43 
 
 		 820 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  22.63 
 
 		 824 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  21.64 
 
 		 812 aa  152  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>