177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0858 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  100 
 
 		 801 aa  1657    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  77.4 
 
 		 800 aa  1328    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  64.04 
 
 		 803 aa  1095    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  78.15 
 
 		 800 aa  1331    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  38.62 
 
 		 839 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.82 
 
 		 805 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  36.41 
 
 		 788 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.22 
 
 		 803 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.98 
 
 		 793 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.35 
 
 		 796 aa  505  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.05 
 
 		 819 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  36.43 
 
 		 790 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  35.18 
 
 		 804 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  37.06 
 
 		 819 aa  492  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.01 
 
 		 805 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  33.01 
 
 		 835 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  33.66 
 
 		 823 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  33.5 
 
 		 822 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.96 
 
 		 785 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  33.91 
 
 		 815 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  31.07 
 
 		 821 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.55 
 
 		 826 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.55 
 
 		 826 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  31.34 
 
 		 830 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  31.52 
 
 		 822 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.47 
 
 		 826 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  33.33 
 
 		 816 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  31.62 
 
 		 831 aa  412  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  31.5 
 
 		 831 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.69 
 
 		 829 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  32.58 
 
 		 826 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  31.54 
 
 		 826 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.66 
 
 		 830 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  29.46 
 
 		 788 aa  368  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  30.93 
 
 		 789 aa  364  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  30.26 
 
 		 789 aa  357  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  28.78 
 
 		 924 aa  339  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  29.05 
 
 		 797 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.89 
 
 		 849 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  28.38 
 
 		 922 aa  323  7e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  26.86 
 
 		 915 aa  317  8e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  28.66 
 
 		 876 aa  314  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  26.34 
 
 		 791 aa  291  3e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  26.18 
 
 		 791 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.05 
 
 		 915 aa  278  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  26.9 
 
 		 804 aa  273  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  29.16 
 
 		 787 aa  272  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.5 
 
 		 791 aa  270  7e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  31.74 
 
 		 561 aa  265  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  29.04 
 
 		 791 aa  264  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  25.67 
 
 		 916 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  26.7 
 
 		 792 aa  239  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  25.5 
 
 		 810 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  29.58 
 
 		 752 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.97 
 
 		 843 aa  229  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  25.31 
 
 		 808 aa  227  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  31.25 
 
 		 816 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  30.47 
 
 		 816 aa  222  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  30.08 
 
 		 816 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.63 
 
 		 850 aa  219  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  30.66 
 
 		 819 aa  219  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  29.07 
 
 		 852 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  29.07 
 
 		 852 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  29.69 
 
 		 816 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  29.62 
 
 		 846 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  29.49 
 
 		 816 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  31.1 
 
 		 840 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  31.1 
 
 		 840 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  29.07 
 
 		 852 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  31.32 
 
 		 840 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  30.27 
 
 		 817 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.5 
 
 		 857 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  30.33 
 
 		 813 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  24.41 
 
 		 824 aa  214  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  30.08 
 
 		 811 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  29.94 
 
 		 809 aa  211  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  26.01 
 
 		 813 aa  210  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  29.21 
 
 		 850 aa  209  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  29.16 
 
 		 823 aa  208  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  28.96 
 
 		 823 aa  207  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  29.75 
 
 		 819 aa  207  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  29.35 
 
 		 817 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.91 
 
 		 827 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  29.94 
 
 		 817 aa  205  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  29.75 
 
 		 817 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  29.88 
 
 		 825 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.49 
 
 		 844 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  27.81 
 
 		 817 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  26.94 
 
 		 819 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  29.94 
 
 		 816 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  27.55 
 
 		 687 aa  197  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  27.68 
 
 		 845 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  28.66 
 
 		 815 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  27.59 
 
 		 817 aa  195  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  27.38 
 
 		 822 aa  194  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  24.03 
 
 		 822 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  29.29 
 
 		 812 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  27.86 
 
 		 820 aa  190  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.35 
 
 		 831 aa  187  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  30.59 
 
 		 813 aa  187  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>