32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2190 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2190  AAA ATPase  100 
 
 		 622 aa  1281    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0020112  hitchhiker  0.0000768998 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1525  AAA ATPase  47.26 
 
 		 624 aa  519  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.368938  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  26.32 
 
 		 875 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  22.86 
 
 		 569 aa  70.1  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.63 
 
 		 621 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  26.33 
 
 		 866 aa  67.4  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.63 
 
 		 866 aa  64.3  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.5 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.62 
 
 		 868 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  25.16 
 
 		 827 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  22.49 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1467  hypothetical protein  24.03 
 
 		 739 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0720  hypothetical protein  22.87 
 
 		 351 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  19.6 
 
 		 893 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  27.55 
 
 		 616 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.27 
 
 		 616 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.69 
 
 		 630 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5543  hypothetical protein  25 
 
 		 818 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.83 
 
 		 629 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.63 
 
 		 608 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.82 
 
 		 618 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.41 
 
 		 631 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.32 
 
 		 595 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.42 
 
 		 611 aa  47.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  22.61 
 
 		 830 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  19.61 
 
 		 629 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  29.7 
 
 		 818 aa  46.6  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  22.94 
 
 		 668 aa  46.2  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  21.91 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  20.04 
 
 		 776 aa  45.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  22.4 
 
 		 777 aa  43.9  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25 
 
 		 609 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>