74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4535 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  99.42 
 
 		 862 aa  1794    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  99.65 
 
 		 862 aa  1798    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  100 
 
 		 862 aa  1801    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  99.54 
 
 		 862 aa  1796    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  55.31 
 
 		 843 aa  972    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  94.66 
 
 		 862 aa  1687    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  99.88 
 
 		 862 aa  1800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  29.07 
 
 		 866 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  29.55 
 
 		 858 aa  362  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  30.29 
 
 		 865 aa  362  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  26.81 
 
 		 875 aa  289  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  25.97 
 
 		 874 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  24.6 
 
 		 864 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.36 
 
 		 868 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  23.65 
 
 		 847 aa  208  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  24.11 
 
 		 864 aa  208  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  24.91 
 
 		 827 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  23.96 
 
 		 860 aa  177  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  22.29 
 
 		 815 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  24.35 
 
 		 855 aa  171  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  24.35 
 
 		 855 aa  171  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  23.75 
 
 		 815 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  24.27 
 
 		 809 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  29.73 
 
 		 815 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  27.19 
 
 		 690 aa  156  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  25.11 
 
 		 866 aa  118  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.27 
 
 		 894 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.92 
 
 		 860 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  20.86 
 
 		 816 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.56 
 
 		 819 aa  99  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.56 
 
 		 811 aa  99  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  28.9 
 
 		 845 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  25.7 
 
 		 841 aa  86.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.55 
 
 		 792 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.63 
 
 		 861 aa  78.2  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.18 
 
 		 837 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.98 
 
 		 629 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.29 
 
 		 629 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  23.83 
 
 		 908 aa  71.2  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.41 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.28 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.14 
 
 		 608 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  23.18 
 
 		 913 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.64 
 
 		 845 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  22.11 
 
 		 699 aa  65.1  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  25.49 
 
 		 843 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  22.11 
 
 		 699 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  22.11 
 
 		 699 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.95 
 
 		 913 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.78 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  24.44 
 
 		 938 aa  60.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.98 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.84 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1002 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  19.69 
 
 		 569 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  24.15 
 
 		 973 aa  54.7  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  25 
 
 		 960 aa  54.7  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.44 
 
 		 866 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  21.69 
 
 		 616 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.58 
 
 		 785 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0826  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1734 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  23.77 
 
 		 889 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  24.55 
 
 		 801 aa  48.1  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  23.2 
 
 		 803 aa  47.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  22.5 
 
 		 610 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  20.8 
 
 		 945 aa  46.6  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.15 
 
 		 566 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  20.45 
 
 		 809 aa  46.2  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  24.58 
 
 		 800 aa  46.2  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  19.76 
 
 		 955 aa  46.2  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  22.71 
 
 		 954 aa  45.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.71 
 
 		 531 aa  45.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  29.2 
 
 		 696 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  23.3 
 
 		 954 aa  44.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>