128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2320 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1773    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  98.83 
 
 		 855 aa  1756    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  87.2 
 
 		 860 aa  1532    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  37.36 
 
 		 874 aa  535  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  31.76 
 
 		 864 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  30.55 
 
 		 864 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  28.89 
 
 		 847 aa  352  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.11 
 
 		 868 aa  342  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  28.9 
 
 		 815 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  26.69 
 
 		 815 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  26.74 
 
 		 809 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  26.64 
 
 		 827 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  25.87 
 
 		 815 aa  257  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  24.32 
 
 		 865 aa  208  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  25.98 
 
 		 875 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  23.97 
 
 		 816 aa  194  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  24.94 
 
 		 866 aa  194  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  27.24 
 
 		 690 aa  194  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.09 
 
 		 866 aa  191  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  22.05 
 
 		 858 aa  168  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  24.13 
 
 		 843 aa  165  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  24.61 
 
 		 862 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  24.48 
 
 		 862 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  24.48 
 
 		 862 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  24.35 
 
 		 862 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  24.35 
 
 		 862 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  24.81 
 
 		 862 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.61 
 
 		 894 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.35 
 
 		 837 aa  90.9  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  24.93 
 
 		 845 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.94 
 
 		 819 aa  88.2  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  27.22 
 
 		 841 aa  88.2  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.47 
 
 		 811 aa  87.8  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.91 
 
 		 861 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  21.69 
 
 		 841 aa  70.1  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.94 
 
 		 608 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  26.17 
 
 		 818 aa  67.4  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.5 
 
 		 915 aa  65.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  23.96 
 
 		 812 aa  65.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.78 
 
 		 860 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  24.71 
 
 		 813 aa  64.7  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  25 
 
 		 866 aa  64.3  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  25.16 
 
 		 916 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  25.36 
 
 		 823 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  23.55 
 
 		 847 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.66 
 
 		 805 aa  62.4  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  25 
 
 		 812 aa  62  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  25.07 
 
 		 812 aa  61.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  24.49 
 
 		 813 aa  60.8  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  24.04 
 
 		 809 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  24.95 
 
 		 823 aa  60.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  22.17 
 
 		 916 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  22.17 
 
 		 916 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  26.1 
 
 		 830 aa  60.1  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.18 
 
 		 785 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  22.66 
 
 		 821 aa  59.3  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.61 
 
 		 611 aa  58.9  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  25.06 
 
 		 822 aa  58.9  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  23.15 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  22.25 
 
 		 843 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0053  VirB4  23.18 
 
 		 822 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.111502  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  24.63 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  24.63 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  22.66 
 
 		 955 aa  58.2  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  24.45 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  23.43 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.08 
 
 		 816 aa  57.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  23.2 
 
 		 816 aa  56.6  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  25.66 
 
 		 814 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  24.1 
 
 		 820 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.53 
 
 		 629 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  23.01 
 
 		 812 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  22.03 
 
 		 747 aa  56.2  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  22.19 
 
 		 814 aa  55.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.25 
 
 		 845 aa  55.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.4 
 
 		 621 aa  55.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  23.24 
 
 		 788 aa  54.3  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  23.54 
 
 		 819 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  24.53 
 
 		 836 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  23.5 
 
 		 829 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  23.77 
 
 		 813 aa  53.5  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  24.55 
 
 		 812 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  23.91 
 
 		 812 aa  53.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  23.85 
 
 		 812 aa  52.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  24.29 
 
 		 813 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.32 
 
 		 595 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  23.62 
 
 		 816 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  23.33 
 
 		 816 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  23.58 
 
 		 812 aa  51.6  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  23.32 
 
 		 814 aa  51.2  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  28.3 
 
 		 908 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  24.13 
 
 		 872 aa  50.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.78 
 
 		 790 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.65 
 
 		 630 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  23.29 
 
 		 817 aa  50.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  23.54 
 
 		 817 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  22.77 
 
 		 819 aa  50.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.23 
 
 		 793 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  22.08 
 
 		 816 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  22.65 
 
 		 811 aa  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>