74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1815 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  100 
 
 		 747 aa  1531    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  34.42 
 
 		 908 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  34.46 
 
 		 836 aa  418  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.16 
 
 		 1043 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  32.58 
 
 		 815 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  31.21 
 
 		 776 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  30.82 
 
 		 668 aa  327  5e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.29 
 
 		 608 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.9 
 
 		 631 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.96 
 
 		 595 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.91 
 
 		 629 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.78 
 
 		 629 aa  171  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.17 
 
 		 630 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.59 
 
 		 657 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.04 
 
 		 611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.05 
 
 		 566 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  21.98 
 
 		 621 aa  114  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1815  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  42.4 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.06 
 
 		 659 aa  108  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  21.47 
 
 		 569 aa  99.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  20.69 
 
 		 893 aa  99  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.51 
 
 		 616 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  23.34 
 
 		 955 aa  89.7  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  22.24 
 
 		 696 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.42 
 
 		 618 aa  89  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  21.52 
 
 		 1085 aa  87.4  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.83 
 
 		 874 aa  84  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.43 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  20.68 
 
 		 809 aa  81.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  19.85 
 
 		 699 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  19.85 
 
 		 699 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  21.54 
 
 		 616 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.77 
 
 		 792 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.83 
 
 		 866 aa  78.2  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  19.85 
 
 		 699 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  23.92 
 
 		 864 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  24.44 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  23.77 
 
 		 847 aa  73.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.93 
 
 		 845 aa  72.4  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.09 
 
 		 815 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  22.07 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.81 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  24.26 
 
 		 843 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  22.54 
 
 		 860 aa  65.1  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.22 
 
 		 711 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  22.16 
 
 		 818 aa  60.8  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.96 
 
 		 868 aa  60.8  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  23.82 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  24.13 
 
 		 495 aa  60.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  24.75 
 
 		 945 aa  59.3  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.61 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  21.65 
 
 		 855 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  23.34 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  22.03 
 
 		 855 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  18.81 
 
 		 663 aa  55.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  34.29 
 
 		 516 aa  54.7  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  34.23 
 
 		 686 aa  54.3  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  21.61 
 
 		 779 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  25.41 
 
 		 485 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  19.37 
 
 		 841 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  25.97 
 
 		 528 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  20.57 
 
 		 461 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.75 
 
 		 819 aa  47.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  20 
 
 		 827 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  18.64 
 
 		 819 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  22 
 
 		 845 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1525  AAA ATPase  32.32 
 
 		 624 aa  45.8  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.368938  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  18.55 
 
 		 805 aa  45.8  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  22.89 
 
 		 511 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  25.84 
 
 		 518 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  22.41 
 
 		 815 aa  45.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  21.29 
 
 		 841 aa  44.7  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0205  AAA ATPase  27.66 
 
 		 385 aa  44.3  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.519462  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  23.62 
 
 		 523 aa  44.3  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>