31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4215 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  88.09 
 
 		 528 aa  881    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1050    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  92.47 
 
 		 485 aa  856    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  53.42 
 
 		 539 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  42.35 
 
 		 624 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  41.59 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  39.47 
 
 		 516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.84 
 
 		 515 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  29.13 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  28.19 
 
 		 496 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2362  hypothetical protein  45.76 
 
 		 144 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.342043  normal  0.319216 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  27.65 
 
 		 511 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  29.33 
 
 		 502 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  28.24 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  26.97 
 
 		 509 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  28.12 
 
 		 711 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.49 
 
 		 696 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.49 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  25.6 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  27.14 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  26.72 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.24 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.92 
 
 		 1043 aa  53.9  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  23.45 
 
 		 818 aa  53.1  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  22.15 
 
 		 610 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.53 
 
 		 659 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  21.79 
 
 		 645 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  32.2 
 
 		 908 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  25.84 
 
 		 747 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.28 
 
 		 815 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  29.92 
 
 		 836 aa  44.3  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>