42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0205 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0205  AAA ATPase  100 
 
 		 385 aa  732    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.519462  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  29.16 
 
 		 500 aa  113  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  30.91 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.01 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  29.29 
 
 		 575 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  30.13 
 
 		 495 aa  103  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.95 
 
 		 696 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  28.42 
 
 		 711 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  28.53 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  26.41 
 
 		 509 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.49 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  25.94 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27 
 
 		 515 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  28.22 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.03 
 
 		 629 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.54 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.95 
 
 		 611 aa  60.1  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  27.95 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  26.87 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.52 
 
 		 595 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.67 
 
 		 631 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  24.19 
 
 		 591 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0308  hypothetical protein  28.37 
 
 		 807 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.287416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  26.16 
 
 		 511 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  24.81 
 
 		 815 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  25.88 
 
 		 820 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  35 
 
 		 621 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.43 
 
 		 1043 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  23.64 
 
 		 815 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  42.67 
 
 		 659 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  21.75 
 
 		 792 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  27.02 
 
 		 516 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  39.44 
 
 		 502 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  35.48 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1100  AAA ATPase  24.29 
 
 		 821 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1445  hypothetical protein  26.43 
 
 		 819 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218302  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  23.1 
 
 		 815 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1131  AAA ATPase  20.85 
 
 		 600 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  27.66 
 
 		 747 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  23.57 
 
 		 547 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  33.82 
 
 		 945 aa  43.5  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  24.84 
 
 		 816 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>