Gene MCAP_0565 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMCAP_0565 
Symbol 
ID3828922 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_007633 
Strand
Start bp673465 
End bp676302 
Gene Length2838 bp 
Protein Length945 aa 
Translation table
GC content23% 
IMG OID637823718 
Producthypothetical protein 
Protein accessionYP_424534 
Protein GI83319829 
COG category[U] Intracellular trafficking, secretion, and vesicular transport 
COG ID[COG3451] Type IV secretory pathway, VirB4 components 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGTTACAAC CTAAAAACAT AAAAAAAACA CAAAATCTAT TTTTAAAAAA TTTCACTTGA 
TTAGATTTTG CTGTTGTGAT TATAATTATT ATTTTATCTG CTTTAATTGG ATATACCATT
TTACCTATTA ATGTAAGTAG AATTTATAAA TTTATACTAT CTTTTATTAT TGGTTCTATT
CTTTCTATTT TATTAATTAA ATCTAATAAA TATAGTTGCA GATACTATAT TTTAGTTATT
AGAATGATTA AATATTTATT TAGTGTTAAA AATTATGATA ATAAAAAAGC TTTTACAAAA
TGATTAGTAC CTTATGAAAG TATATTAGAA AACCAGTTTG TTAAAACTAA GCCTGGAAGA
CTTGGTTCTA AATATTTTTC AATTTTAAGA TTTAAAGGTA AAAATCCATG AATAGAAGAT
GAAAAAGATA AAGATGCTTT TTTAAACAAA TTTACTAATT TGATTGATTC AACTCAATTT
CATATTAGTT TTATTAGAAA AAAAGAATTA TCTGATTACA CTAAGAATTT TCAAAATTTA
GAAGAAAACT TTTTAAAGAA AAAAGAGTAT TTAAAACAAA AACAAGCCGA CATAAAAGTT
CAACAAAATT TTACTACATA TTATGAAAAT GTATTTTTAG ATTTAAATAG CCTAGATACT
GAATTTCTAG TTGATAAGTA TTATATAGCA GTATATGCTA AAAACATTTT TGACCTTAAA
AAGTCAATTG ATGAAACAAT TAGTATGCTA AATTCTATGG AAATTGAAAA TGAAGTTATT
AAAGGTGTTG AATTAATTGA GTTTTTAGGA GCTTTAAATA ATAAAGAAAT TGACAAACAA
CAAGCTATTA AGTATTTAAA CTATGAAAAT GAAAATTCAA AACAAAAGCT TGCAAAAAAA
CAACAACAAA ATCATAATGA TCAAACCTTT TGAGAGTTTA TTAAAAGTAA ATTAAATGTT
TTTAATTTTA AAAAACAAGA AAAAGAAACT AAAAATCAAA TTAAAGAACT AAAGCTTGAT
GAAATTTTAG CAAATGATAA TTTAGTATTT AAGCATAATT ATTTTATTCA AGATGGAGTT
TATTGTTCAA TTCATACAAT AAGTGAATTG CCTTTAACTT TACCTGATGG TTGAGCAATT
AAAATCTTTG ATTCAGATTC AACAATTGTA TGAAATCTAT CAATTTTTAG TGAAGATGTT
CAAGCTGCTT TATTAGATAA AACAGGTAAG AAAATGGTAG ATAATTCTAC ACTAATAAAA
TCTAAATATT TTAAAAAACA AGAAAGCTTA CAATTAGAAG CTTTAGAATA TTTAGAAAAT
CAGCTACAAA TTAATCGCAA TGTTTTAACT AATAGTAGTC TAATGATTAT TAATAGTGCT
GAAAGCTTAA AAGAATTAAG AAAAATAGAA GCTAAAAATT TTGCTAATGC TAAAAAAATA
AAAATTAATA TTAATCCGAT TCCTTTTAAA CAATTTGAAG GACTAGCACA AGCTTGTTTA
ATTACTACTA ACACATTAAA TCAAGGAATT CCAATGAGTT CTTATAATAT AGCTTATGGT
TGAGCCTTTG AAAATGAAGA AAATAATGAT AACAATATGT TTATTCTGGG AGAAAGCGAT
TCAACTGGAG AACCAATTAT CTTTAATCAA TTTTATAAAA GTAATTCAAT ACGCTCTAAT
TACAATATGT TTACTGTTGG AAGTAGTGGA AAAGGAAAAT CAACTGATGT TAAAAAGGCG
ATTTTAGCTA ATTTAGCACA AAACAATAGA GTTTATATTA TAGATCCACA AAATGAATAT
TCAACTTTAG GTAGAGAATT TGGAGCTAGT TTAATTGATT TAGGACTAGG ACACAATACA
GTAATTAATC CTTTAGAAGT TCAAATTCTT TTAATTGAAG AAGATGGTTT TAATGAAAAC
GAAAGCTATC CAATTAAATC AATTATTAAT AATCATTTTG ACTGATTAGA AAAATTCTTT
AGTTTAATTA ATAATGATTG AACTAGAGAT GATTTAGTTT TGGTTATGAA TTTTGTAAAA
AATCTGTACA CTAATTTAGG TTTATATGAT GTTCAAACAA TACAACAATT AAAAAGCTTC
AAATATCCAG TAATGTCAGA TTTAATTAGT TTAATTAATA ATTATCAATT TACTGATGAA
TTTGATAAGA GAAGAAAACA AACTAAGCTA GCTAATATTC TTGATAGGCT AACTTTTGAT
TTTGAATATA ATGGAAAATA TCAATTAATT TATAATGGGC AAACTAATAT TGATTTAAGC
AATGATTTTA TTATTTTTAA TACTAAAAAC TTAGCTAATT CAGGTAGTGG TAATGAAAAT
GTAGGTTTAT ATGTGTTATT AAGTTTTATT CAAAATCAAA TCTTTAATAA CATAATTGAA
AACCCTGATA CAAATACAGT TTTAGTAATT GATGAGCTTC ATAAGTATAT TGATCCTAAT
AATACTACAA CACTTGACTT TGTTTATACA ATGACAAAGA CAGTTAGAAA ATTTAATGCT
GGGATGATTT TGTGCACTCA AAATCCATCA GACTTTTTAG GTTCATCTAT GATAACTAAA
AAAGCTGAAG CAATTTTGCA AAACTGTCAA TATGCTAAAT TTTTTGGTTT AAAACAAAAA
GACTTAGAGG CTGTTGTTGA TATGTTTAGA TCAACTGGTG GTTTAAATGA TTCTCATCAA
AGTTATTTAG CTGATAGTAA GATTGGAAAC TTAATCTTTA GCTTAAATAT GTATTCAAAA
ATTAAAATGA GTATTTATTA TAACGATTTT GAAAAAGAAC TCTTTTTTAC AAAACAAAAA
AAAGGAGAAA AAAAATAA
 
Protein sequence
MLQPKNIKKT QNLFLKNFTW LDFAVVIIII ILSALIGYTI LPINVSRIYK FILSFIIGSI 
LSILLIKSNK YSCRYYILVI RMIKYLFSVK NYDNKKAFTK WLVPYESILE NQFVKTKPGR
LGSKYFSILR FKGKNPWIED EKDKDAFLNK FTNLIDSTQF HISFIRKKEL SDYTKNFQNL
EENFLKKKEY LKQKQADIKV QQNFTTYYEN VFLDLNSLDT EFLVDKYYIA VYAKNIFDLK
KSIDETISML NSMEIENEVI KGVELIEFLG ALNNKEIDKQ QAIKYLNYEN ENSKQKLAKK
QQQNHNDQTF WEFIKSKLNV FNFKKQEKET KNQIKELKLD EILANDNLVF KHNYFIQDGV
YCSIHTISEL PLTLPDGWAI KIFDSDSTIV WNLSIFSEDV QAALLDKTGK KMVDNSTLIK
SKYFKKQESL QLEALEYLEN QLQINRNVLT NSSLMIINSA ESLKELRKIE AKNFANAKKI
KININPIPFK QFEGLAQACL ITTNTLNQGI PMSSYNIAYG WAFENEENND NNMFILGESD
STGEPIIFNQ FYKSNSIRSN YNMFTVGSSG KGKSTDVKKA ILANLAQNNR VYIIDPQNEY
STLGREFGAS LIDLGLGHNT VINPLEVQIL LIEEDGFNEN ESYPIKSIIN NHFDWLEKFF
SLINNDWTRD DLVLVMNFVK NLYTNLGLYD VQTIQQLKSF KYPVMSDLIS LINNYQFTDE
FDKRRKQTKL ANILDRLTFD FEYNGKYQLI YNGQTNIDLS NDFIIFNTKN LANSGSGNEN
VGLYVLLSFI QNQIFNNIIE NPDTNTVLVI DELHKYIDPN NTTTLDFVYT MTKTVRKFNA
GMILCTQNPS DFLGSSMITK KAEAILQNCQ YAKFFGLKQK DLEAVVDMFR STGGLNDSHQ
SYLADSKIGN LIFSLNMYSK IKMSIYYNDF EKELFFTKQK KGEKK