64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0565 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 945 aa  1898    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  28.1 
 
 		 955 aa  167  8e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  28.41 
 
 		 818 aa  153  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.46 
 
 		 609 aa  131  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  25.33 
 
 		 610 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  23.68 
 
 		 610 aa  108  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  24.32 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.56 
 
 		 608 aa  87.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  23.54 
 
 		 644 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  21.9 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  19.68 
 
 		 893 aa  77.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.51 
 
 		 630 aa  75.5  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.54 
 
 		 629 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.19 
 
 		 629 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.8 
 
 		 621 aa  72.8  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.66 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  19.64 
 
 		 595 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  25.65 
 
 		 711 aa  68.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.87 
 
 		 836 aa  67.8  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.44 
 
 		 611 aa  63.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.84 
 
 		 566 aa  63.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  22.69 
 
 		 776 aa  63.5  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  23.46 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  24.75 
 
 		 747 aa  59.3  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  21.35 
 
 		 864 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  20.74 
 
 		 874 aa  56.6  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  23.16 
 
 		 699 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  23.16 
 
 		 699 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  20.97 
 
 		 847 aa  56.2  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  22.41 
 
 		 809 aa  55.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  22 
 
 		 830 aa  55.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.55 
 
 		 861 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.69 
 
 		 868 aa  53.5  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.31 
 
 		 815 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  24.16 
 
 		 699 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.23 
 
 		 515 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  19.68 
 
 		 815 aa  52.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1119  Type IV secretory pathway, VirB4 component  20.94 
 
 		 651 aa  52  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0551888  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  19.86 
 
 		 659 aa  51.6  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.36 
 
 		 1043 aa  51.6  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25 
 
 		 657 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  25 
 
 		 813 aa  50.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  21.89 
 
 		 860 aa  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  21.27 
 
 		 668 aa  49.7  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.12 
 
 		 618 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  26.57 
 
 		 855 aa  48.5  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  24.19 
 
 		 816 aa  48.5  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  24.46 
 
 		 836 aa  48.9  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  20.49 
 
 		 815 aa  48.5  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  21.11 
 
 		 847 aa  48.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  22.7 
 
 		 569 aa  48.1  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  32.88 
 
 		 505 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  20.98 
 
 		 815 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  34.69 
 
 		 792 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  23.96 
 
 		 836 aa  47  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.35 
 
 		 495 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  25.87 
 
 		 855 aa  47  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  25.88 
 
 		 812 aa  46.2  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  21.61 
 
 		 865 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.33 
 
 		 616 aa  45.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.36 
 
 		 796 aa  45.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.04 
 
 		 802 aa  44.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  23.74 
 
 		 809 aa  44.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  30.56 
 
 		 511 aa  44.3  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>