56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1056 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  100 
 
 		 566 aa  1159    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.51 
 
 		 608 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  22.97 
 
 		 893 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.5 
 
 		 611 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.58 
 
 		 629 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  25.05 
 
 		 747 aa  115  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  22.53 
 
 		 663 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.59 
 
 		 629 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.04 
 
 		 595 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.3 
 
 		 815 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.38 
 
 		 631 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.5 
 
 		 1043 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.46 
 
 		 630 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  23.06 
 
 		 776 aa  98.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  22.58 
 
 		 569 aa  97.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  21.88 
 
 		 908 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.45 
 
 		 836 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  20.92 
 
 		 1085 aa  89.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.46 
 
 		 657 aa  80.9  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  22.24 
 
 		 616 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  26.81 
 
 		 668 aa  75.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  22.41 
 
 		 711 aa  75.1  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  25.32 
 
 		 699 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  25.32 
 
 		 699 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  25.32 
 
 		 699 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  26.09 
 
 		 815 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.56 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  20.44 
 
 		 621 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  25.61 
 
 		 696 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.95 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  21.88 
 
 		 865 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  23.05 
 
 		 945 aa  62  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  22.25 
 
 		 864 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  28.28 
 
 		 866 aa  60.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  24.58 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.05 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  25.16 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.67 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.56 
 
 		 868 aa  57.4  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0163  hypothetical protein  24.59 
 
 		 323 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427999  hitchhiker  1.86977e-20 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5109  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  22.02 
 
 		 695 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.84 
 
 		 861 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2190  AAA ATPase  21.71 
 
 		 622 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0020112  hitchhiker  0.0000768998 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1525  AAA ATPase  26.23 
 
 		 624 aa  52.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.368938  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0167  hypothetical protein  22.61 
 
 		 322 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0100015  hitchhiker  6.88403e-24 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  27.59 
 
 		 845 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  27.59 
 
 		 843 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  21.71 
 
 		 864 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  20.21 
 
 		 847 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  22.7 
 
 		 816 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  23.22 
 
 		 818 aa  45.8  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  22.9 
 
 		 845 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.82 
 
 		 557 aa  44.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  23.17 
 
 		 813 aa  44.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  19.93 
 
 		 827 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  20.57 
 
 		 866 aa  43.5  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>