69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1502 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  100 
 
 		 609 aa  1268    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  82.57 
 
 		 610 aa  1055    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  26.68 
 
 		 610 aa  204  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  25.46 
 
 		 945 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  25.54 
 
 		 818 aa  106  1e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  23.87 
 
 		 955 aa  98.6  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.54 
 
 		 611 aa  97.8  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.49 
 
 		 621 aa  90.1  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  20.81 
 
 		 569 aa  88.6  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  23.3 
 
 		 644 aa  87  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.26 
 
 		 595 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  23.43 
 
 		 747 aa  81.3  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.84 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.83 
 
 		 631 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.94 
 
 		 659 aa  77  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  22.52 
 
 		 699 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  21.33 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.15 
 
 		 630 aa  73.9  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.75 
 
 		 629 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  21.12 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  21.12 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.52 
 
 		 1043 aa  71.2  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  24.35 
 
 		 776 aa  70.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.93 
 
 		 608 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1119  Type IV secretory pathway, VirB4 component  22.93 
 
 		 651 aa  65.1  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0551888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  24.2 
 
 		 616 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  20.99 
 
 		 893 aa  62  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  23.59 
 
 		 686 aa  61.2  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.43 
 
 		 815 aa  60.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.75 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  23.25 
 
 		 817 aa  60.5  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  21.74 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  26.24 
 
 		 668 aa  58.9  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  20.18 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  21.92 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  20.52 
 
 		 827 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30 
 
 		 802 aa  55.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  21.28 
 
 		 809 aa  54.7  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  22.57 
 
 		 518 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.4 
 
 		 861 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  21.22 
 
 		 841 aa  53.9  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  23.22 
 
 		 874 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28 
 
 		 802 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.48 
 
 		 868 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  23.88 
 
 		 485 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  21.16 
 
 		 1085 aa  51.6  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  22.91 
 
 		 687 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  22.93 
 
 		 815 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.97 
 
 		 815 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  28.03 
 
 		 847 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  24.09 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  24.29 
 
 		 822 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.32 
 
 		 836 aa  48.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  22.4 
 
 		 815 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  22.83 
 
 		 908 aa  47.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  22.47 
 
 		 845 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  19.83 
 
 		 663 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0053  VirB4  23.12 
 
 		 822 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.111502  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  23.62 
 
 		 690 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  23.71 
 
 		 813 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.64 
 
 		 843 aa  45.8  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0720  hypothetical protein  30.51 
 
 		 351 aa  44.3  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  23.19 
 
 		 816 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  27.55 
 
 		 875 aa  44.3  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0167  hypothetical protein  20.57 
 
 		 322 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0100015  hitchhiker  6.88403e-24 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  28.07 
 
 		 864 aa  43.9  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  31.18 
 
 		 496 aa  43.5  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  20.18 
 
 		 788 aa  43.5  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0231  hypothetical protein  23.5 
 
 		 846 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>