66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3127 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1263    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.68 
 
 		 609 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  27.05 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  25.7 
 
 		 818 aa  154  4e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  21.23 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.03 
 
 		 630 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.06 
 
 		 629 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.75 
 
 		 631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.55 
 
 		 629 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.35 
 
 		 608 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  21.85 
 
 		 645 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  22.05 
 
 		 644 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  23.68 
 
 		 945 aa  102  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  23.56 
 
 		 955 aa  100  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  21.36 
 
 		 621 aa  97.8  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.26 
 
 		 611 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.24 
 
 		 595 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.27 
 
 		 1043 aa  84  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1119  Type IV secretory pathway, VirB4 component  23.11 
 
 		 651 aa  78.2  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0551888  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  20.42 
 
 		 893 aa  78.2  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  23.39 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.74 
 
 		 659 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.13 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  22.08 
 
 		 1085 aa  70.9  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  22.07 
 
 		 747 aa  69.3  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  23 
 
 		 699 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.09 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  21.97 
 
 		 699 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  21.97 
 
 		 699 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  22.7 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  21 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  21.54 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.07 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  23.6 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  34.86 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.32 
 
 		 815 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.48 
 
 		 495 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.64 
 
 		 711 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  21.6 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  22.6 
 
 		 874 aa  54.7  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  21.47 
 
 		 875 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.82 
 
 		 811 aa  53.9  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  27.78 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  21.59 
 
 		 616 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  27.78 
 
 		 495 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.82 
 
 		 819 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  27.78 
 
 		 668 aa  53.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  23.38 
 
 		 696 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  22.03 
 
 		 809 aa  50.4  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  21.58 
 
 		 496 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.67 
 
 		 836 aa  47.4  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.7 
 
 		 815 aa  47.4  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  29.1 
 
 		 618 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  25.48 
 
 		 862 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  20.75 
 
 		 815 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  27.2 
 
 		 862 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  27.2 
 
 		 862 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  27.2 
 
 		 862 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  27.2 
 
 		 862 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  23.29 
 
 		 835 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  21.1 
 
 		 858 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  25.64 
 
 		 827 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  25.48 
 
 		 862 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.5 
 
 		 792 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  21.97 
 
 		 865 aa  43.9  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  21.41 
 
 		 908 aa  43.5  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>