47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8941 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1023    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  69.54 
 
 
515 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  42.18 
 
 
502 aa  310  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  38.21 
 
 
511 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  38.74 
 
 
496 aa  296  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  38.29 
 
 
512 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  35.98 
 
 
495 aa  240  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  35.65 
 
 
711 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  35.5 
 
 
696 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  32.64 
 
 
495 aa  231  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  33.26 
 
 
495 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  32.44 
 
 
509 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  32.7 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  30.69 
 
 
500 aa  196  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  27.68 
 
 
539 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  31.12 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  29.61 
 
 
480 aa  144  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  29.18 
 
 
532 aa  143  8e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  29.22 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  28.48 
 
 
518 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  28.91 
 
 
485 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  25.58 
 
 
624 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  27.29 
 
 
575 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  28.3 
 
 
569 aa  87.8  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.4 
 
 
629 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.71 
 
 
630 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.2 
 
 
629 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.42 
 
 
631 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.51 
 
 
608 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.56 
 
 
611 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  22.96 
 
 
792 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.71 
 
 
595 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  23.6 
 
 
610 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.43 
 
 
616 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0308  hypothetical protein  24.02 
 
 
807 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.287416  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  22.28 
 
 
616 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.76 
 
 
657 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.04 
 
 
659 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.51 
 
 
866 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  20.26 
 
 
621 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.93 
 
 
618 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0205  AAA ATPase  32.77 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.519462  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  28.83 
 
 
818 aa  49.7  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  32.88 
 
 
945 aa  47.4  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.56 
 
 
802 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.08 
 
 
868 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.52 
 
 
802 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>