109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1395 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  88.82 
 
 		 618 aa  1044    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  100 
 
 		 616 aa  1221    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.04 
 
 		 595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  29.59 
 
 		 657 aa  137  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.53 
 
 		 629 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  28.08 
 
 		 629 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.48 
 
 		 621 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.8 
 
 		 608 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.87 
 
 		 659 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.68 
 
 		 631 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.17 
 
 		 630 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  24.04 
 
 		 569 aa  120  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.54 
 
 		 611 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  25.72 
 
 		 616 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  23.71 
 
 		 747 aa  104  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  24.71 
 
 		 908 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.18 
 
 		 815 aa  97.4  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.6 
 
 		 1043 aa  94.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  25.82 
 
 		 668 aa  93.6  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  27.58 
 
 		 866 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.74 
 
 		 836 aa  89.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  22.68 
 
 		 893 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  19.76 
 
 		 955 aa  85.5  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  21.4 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  24.2 
 
 		 809 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  26.14 
 
 		 861 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.74 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.66 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.65 
 
 		 868 aa  70.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  22.01 
 
 		 1085 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  23.41 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  24.38 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.5 
 
 		 792 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  25.43 
 
 		 505 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  20.64 
 
 		 663 aa  66.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  23.64 
 
 		 847 aa  65.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  21.69 
 
 		 845 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1577 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  23.92 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  22.44 
 
 		 874 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  22.13 
 
 		 696 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  23.89 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  21.63 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  23.79 
 
 		 864 aa  60.8  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.85 
 
 		 515 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  22.05 
 
 		 827 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  23.35 
 
 		 824 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  25.39 
 
 		 866 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  23.08 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  20.41 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  21.61 
 
 		 945 aa  56.2  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  23.32 
 
 		 858 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.55 
 
 		 711 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.51 
 
 		 609 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  23.71 
 
 		 509 aa  54.3  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  23.67 
 
 		 865 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  21.76 
 
 		 818 aa  53.1  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  25.69 
 
 		 820 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.95 
 
 		 696 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.67 
 
 		 860 aa  52.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  22.28 
 
 		 610 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  20.87 
 
 		 610 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.12 
 
 		 811 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  22.26 
 
 		 924 aa  50.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  25.5 
 
 		 516 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  22.54 
 
 		 547 aa  50.4  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  17.91 
 
 		 819 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  25.55 
 
 		 624 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  35.45 
 
 		 777 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2190  AAA ATPase  27.27 
 
 		 622 aa  49.7  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0020112  hitchhiker  0.0000768998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  20.56 
 
 		 960 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1525  AAA ATPase  31.48 
 
 		 624 aa  48.9  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.368938  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  29.77 
 
 		 862 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  25.75 
 
 		 1065 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  21.48 
 
 		 815 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  20.74 
 
 		 938 aa  47.4  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 		 998 aa  47  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.84 
 
 		 803 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  22.2 
 
 		 963 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  22.46 
 
 		 963 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  21.67 
 
 		 955 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  24.04 
 
 		 819 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  22.88 
 
 		 839 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  21.1 
 
 		 699 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  25.75 
 
 		 1065 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  22.41 
 
 		 841 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  33.33 
 
 		 779 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  21.1 
 
 		 699 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  23.79 
 
 		 815 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  23.91 
 
 		 989 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  24.01 
 
 		 843 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  23.68 
 
 		 699 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  21.88 
 
 		 908 aa  45.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.53 
 
 		 821 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  22.41 
 
 		 817 aa  45.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  24.68 
 
 		 862 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  26.49 
 
 		 862 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  24.68 
 
 		 862 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  26.49 
 
 		 862 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  22.74 
 
 		 801 aa  44.7  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>