66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2753 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1264    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  82.57 
 
 		 609 aa  1035    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  27.05 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  25.33 
 
 		 945 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  24.61 
 
 		 818 aa  99  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  23.02 
 
 		 955 aa  91.3  5e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  24.22 
 
 		 621 aa  87.8  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.2 
 
 		 611 aa  83.6  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  20.39 
 
 		 569 aa  81.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  22.11 
 
 		 644 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  24.44 
 
 		 747 aa  74.3  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  20.94 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.55 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  23.5 
 
 		 776 aa  66.6  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.69 
 
 		 659 aa  67  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.9 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.59 
 
 		 1043 aa  65.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  20.75 
 
 		 847 aa  64.3  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.3 
 
 		 608 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  19.41 
 
 		 631 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  19.5 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1119  Type IV secretory pathway, VirB4 component  23.37 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0551888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.43 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  20.32 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  23.47 
 
 		 817 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  20.68 
 
 		 809 aa  55.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  20.75 
 
 		 815 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  23.47 
 
 		 668 aa  55.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.44 
 
 		 868 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  20.07 
 
 		 699 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  20.5 
 
 		 699 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  20.5 
 
 		 699 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  19.13 
 
 		 827 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  24.22 
 
 		 813 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  19.31 
 
 		 893 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  23.13 
 
 		 908 aa  50.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  20 
 
 		 874 aa  50.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  30.08 
 
 		 843 aa  50.8  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.09 
 
 		 791 aa  50.4  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  20.34 
 
 		 816 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  25.15 
 
 		 616 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.84 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  23.89 
 
 		 687 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  27.93 
 
 		 528 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  23.23 
 
 		 686 aa  48.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  22 
 
 		 861 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.49 
 
 		 815 aa  47.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  27.93 
 
 		 485 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.24 
 
 		 840 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0720  hypothetical protein  30.97 
 
 		 351 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  22.62 
 
 		 788 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  20 
 
 		 864 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.24 
 
 		 840 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  21.14 
 
 		 841 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  19.47 
 
 		 1034 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  23.63 
 
 		 840 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  30.91 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  28.67 
 
 		 822 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  23.91 
 
 		 518 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  28.1 
 
 		 823 aa  44.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  22.91 
 
 		 815 aa  44.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  28.1 
 
 		 823 aa  44.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.52 
 
 		 657 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  26.83 
 
 		 819 aa  43.9  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.84 
 
 		 836 aa  43.9  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  22.85 
 
 		 860 aa  43.9  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>