106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0467 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  100 
 
 
1034 aa  2051    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  65.21 
 
 
989 aa  1191    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  78.61 
 
 
989 aa  1527    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  44.09 
 
 
1097 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  47.59 
 
 
1143 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  34.03 
 
 
902 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  36.38 
 
 
1040 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0832  hypothetical protein  30.72 
 
 
1037 aa  237  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0817  ATPase  31.67 
 
 
1039 aa  235  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.331244  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  34.8 
 
 
1065 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  33.63 
 
 
911 aa  230  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  35.57 
 
 
1065 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  35.14 
 
 
930 aa  220  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  30.61 
 
 
1090 aa  203  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  24.4 
 
 
499 aa  67.4  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1783  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.03 
 
 
555 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000734669  normal  0.0773892 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  23.81 
 
 
499 aa  65.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.25 
 
 
505 aa  64.7  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  22.28 
 
 
517 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.24 
 
 
515 aa  62.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  22.56 
 
 
841 aa  62.4  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  25.55 
 
 
508 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3639  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  48.33 
 
 
522 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0432207  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3712  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  48.33 
 
 
522 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.534024  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3644  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  48.33 
 
 
523 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.852861  normal  0.874146 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  20.77 
 
 
533 aa  60.1  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.69 
 
 
580 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  21.91 
 
 
516 aa  59.7  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0915  hypothetical protein  23.37 
 
 
463 aa  59.3  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4413  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.96 
 
 
523 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4099  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  50 
 
 
530 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0823505  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12532  hypothetical protein  46.67 
 
 
533 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.86 
 
 
579 aa  58.9  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1018  ATPase  23.37 
 
 
463 aa  58.2  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  25.52 
 
 
570 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  27.19 
 
 
508 aa  57.4  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.75 
 
 
531 aa  57.4  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  48.21 
 
 
526 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.27 
 
 
837 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1887  hypothetical protein  18.77 
 
 
870 aa  57.4  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.53 
 
 
520 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  24.23 
 
 
1698 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2013  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  44.07 
 
 
533 aa  56.2  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  23.5 
 
 
1043 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3542  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.24 
 
 
543 aa  55.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.26 
 
 
565 aa  54.7  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  22.84 
 
 
600 aa  54.7  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0823  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.6 
 
 
522 aa  54.7  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2022  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.77 
 
 
557 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  23.65 
 
 
492 aa  53.5  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2056  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.47 
 
 
552 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.42 
 
 
819 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  40.98 
 
 
529 aa  52.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1768  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.64 
 
 
522 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.307535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0936  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.3 
 
 
521 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.88 
 
 
513 aa  51.6  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25 
 
 
524 aa  51.6  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2231  hypothetical protein  24.68 
 
 
521 aa  51.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0965874  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  24.42 
 
 
670 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0091  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.46 
 
 
488 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0259973  normal  0.193086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  28.83 
 
 
709 aa  49.7  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  20.41 
 
 
537 aa  49.3  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  26.15 
 
 
540 aa  48.9  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4744  hypothetical protein  30.85 
 
 
500 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0318785  normal  0.98435 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  38.6 
 
 
511 aa  48.9  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  45.61 
 
 
540 aa  48.9  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  23.78 
 
 
1144 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04129  predicted ATPase  37.78 
 
 
500 aa  48.5  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.431713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04093  hypothetical protein  37.78 
 
 
500 aa  48.5  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2235  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.49 
 
 
514 aa  48.5  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173047  normal  0.0160652 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  26.55 
 
 
609 aa  47.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  25.64 
 
 
557 aa  47.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  23.27 
 
 
569 aa  48.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  30.91 
 
 
574 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.58 
 
 
674 aa  47.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4878  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.39 
 
 
521 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.493177 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3734  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  36.67 
 
 
500 aa  47  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.600698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  24.23 
 
 
751 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1336  hypothetical protein  24.47 
 
 
509 aa  47  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4519  hypothetical protein  30.85 
 
 
500 aa  47  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000859541  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4836  hypothetical protein  30.85 
 
 
500 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000653742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3749  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  30.85 
 
 
500 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4817  hypothetical protein  30.85 
 
 
500 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00312271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  26.4 
 
 
590 aa  47.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0236  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.19 
 
 
496 aa  47  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3529  hypothetical protein  22.75 
 
 
536 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  24.49 
 
 
747 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  30.94 
 
 
664 aa  46.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  26.39 
 
 
1100 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2189  hypothetical protein  23.24 
 
 
535 aa  45.8  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.39 
 
 
523 aa  45.8  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  25.86 
 
 
589 aa  45.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  22.88 
 
 
577 aa  45.8  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  21.32 
 
 
610 aa  46.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4068  hypothetical protein  24.88 
 
 
541 aa  45.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0578  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.33 
 
 
520 aa  45.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215105  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  29.13 
 
 
501 aa  45.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4269  cell division FtsK/SpoIIIE  31.36 
 
 
762 aa  45.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1897  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  22.69 
 
 
503 aa  45.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0908491  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3029  hypothetical protein  25.25 
 
 
536 aa  45.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.998506  normal  0.572623 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>