122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2954 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  80.34 
 
 		 590 aa  970    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1201    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  42.36 
 
 		 592 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  40.8 
 
 		 589 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  25.41 
 
 		 623 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  22.85 
 
 		 709 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  23.12 
 
 		 709 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  24.02 
 
 		 427 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  22.26 
 
 		 574 aa  104  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  22.92 
 
 		 595 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  21.1 
 
 		 567 aa  100  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  25.2 
 
 		 601 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  21.81 
 
 		 603 aa  98.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  35.42 
 
 		 600 aa  98.6  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  23.8 
 
 		 575 aa  97.8  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  30.1 
 
 		 617 aa  95.9  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  27.27 
 
 		 670 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  32.61 
 
 		 714 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  27.87 
 
 		 659 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  22.3 
 
 		 679 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  23.54 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  39.26 
 
 		 674 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  39.13 
 
 		 664 aa  84  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  28.57 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  21.05 
 
 		 599 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  21.86 
 
 		 561 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  33.55 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  31.14 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  32.22 
 
 		 607 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  28.49 
 
 		 579 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  31.62 
 
 		 570 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  21.34 
 
 		 626 aa  77.4  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  25.89 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  28.57 
 
 		 569 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  20.4 
 
 		 590 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  27.53 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  26.51 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  34.56 
 
 		 594 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  28.89 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  28.57 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  31.48 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.5 
 
 		 593 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  29.49 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  25.53 
 
 		 583 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  31.62 
 
 		 591 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  33.09 
 
 		 587 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.88 
 
 		 591 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  20.17 
 
 		 612 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.62 
 
 		 611 aa  67.8  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  28.78 
 
 		 616 aa  66.2  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  27.63 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  24.47 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  27.01 
 
 		 608 aa  65.5  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  29.1 
 
 		 559 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.05 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  23.4 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  23.94 
 
 		 628 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  23.73 
 
 		 583 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  21.3 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  23.4 
 
 		 617 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  25.52 
 
 		 693 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  31.3 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  24.47 
 
 		 583 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  27.59 
 
 		 526 aa  62  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  26.39 
 
 		 496 aa  62  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  26.62 
 
 		 563 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  21.19 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  20.22 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  28.81 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  29.79 
 
 		 560 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  30.83 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  28.37 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  24.31 
 
 		 679 aa  57  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  26.47 
 
 		 497 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  23.31 
 
 		 651 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  20.11 
 
 		 570 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.47 
 
 		 493 aa  56.2  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  25.36 
 
 		 497 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  26.09 
 
 		 497 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  23.38 
 
 		 674 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  31.03 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  26.55 
 
 		 1065 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  30.25 
 
 		 360 aa  54.7  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  22.65 
 
 		 662 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  23.87 
 
 		 546 aa  53.5  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  26.55 
 
 		 1065 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  34.17 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  26.98 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.97 
 
 		 628 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  20.28 
 
 		 532 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  26.72 
 
 		 989 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  29.32 
 
 		 495 aa  48.5  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  23.78 
 
 		 452 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3943  hypothetical protein  29.66 
 
 		 466 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  25.81 
 
 		 540 aa  47.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  30.95 
 
 		 537 aa  47.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  24.36 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3692  protein of unknown function DUF87  24.73 
 
 		 382 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  24.24 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  28.45 
 
 		 524 aa  47  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>