61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5437 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  100 
 
 
1143 aa  2233    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  63.95 
 
 
1097 aa  850    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  46.74 
 
 
989 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  47.25 
 
 
989 aa  499  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  47.59 
 
 
1034 aa  489  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  35.24 
 
 
902 aa  274  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  37.35 
 
 
1040 aa  244  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0817  ATPase  33 
 
 
1039 aa  227  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.331244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0832  hypothetical protein  32.82 
 
 
1037 aa  220  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842823  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  34.18 
 
 
1065 aa  211  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  34.18 
 
 
1065 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  32.94 
 
 
911 aa  205  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  28.18 
 
 
1090 aa  192  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  31.15 
 
 
930 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.8 
 
 
505 aa  69.7  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.26 
 
 
513 aa  65.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  24.3 
 
 
517 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.22 
 
 
520 aa  62.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  26.19 
 
 
499 aa  60.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  22.65 
 
 
516 aa  59.7  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  26.96 
 
 
508 aa  58.9  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  25.85 
 
 
499 aa  58.5  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4413  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.61 
 
 
523 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.47 
 
 
511 aa  57  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1887  hypothetical protein  17.99 
 
 
870 aa  56.2  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  27.27 
 
 
1698 aa  55.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  28.95 
 
 
557 aa  53.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  31.53 
 
 
531 aa  52.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.7 
 
 
580 aa  52  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  47.06 
 
 
526 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  23.8 
 
 
544 aa  50.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4099  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  41.03 
 
 
530 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0823505  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  33.77 
 
 
540 aa  49.7  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1783  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  45.1 
 
 
555 aa  49.7  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000734669  normal  0.0773892 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  33.64 
 
 
600 aa  48.5  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3644  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  45.1 
 
 
523 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.852861  normal  0.874146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3712  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  45.61 
 
 
522 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.534024  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3639  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  45.61 
 
 
522 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0432207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  36 
 
 
539 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  38.2 
 
 
515 aa  47.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  27.48 
 
 
590 aa  47.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  31.78 
 
 
679 aa  47  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2056  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.42 
 
 
552 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  32.71 
 
 
623 aa  46.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  24.09 
 
 
427 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1736  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  42.86 
 
 
629 aa  46.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12532  hypothetical protein  42.37 
 
 
533 aa  46.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  30.46 
 
 
709 aa  46.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  32.5 
 
 
591 aa  45.8  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  30.77 
 
 
709 aa  45.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  27.12 
 
 
589 aa  45.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.79 
 
 
565 aa  45.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.85 
 
 
501 aa  45.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  21.26 
 
 
572 aa  45.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  32 
 
 
530 aa  45.1  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  36.05 
 
 
611 aa  44.7  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0096  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  36.27 
 
 
490 aa  44.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  23.39 
 
 
570 aa  44.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0091  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  33.58 
 
 
488 aa  44.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0259973  normal  0.193086 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  28.12 
 
 
659 aa  44.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3529  hypothetical protein  26.29 
 
 
536 aa  44.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>