170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2465 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  100 
 
 		 600 aa  1226    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  57.61 
 
 		 427 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  44.17 
 
 		 567 aa  459  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  42.88 
 
 		 574 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  40.11 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3692  protein of unknown function DUF87  46.77 
 
 		 382 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  24.92 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  27.14 
 
 		 577 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  24.78 
 
 		 595 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  24.79 
 
 		 546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  26.67 
 
 		 575 aa  126  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  23.72 
 
 		 593 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  23.65 
 
 		 592 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  25.22 
 
 		 550 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  24.95 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  27.04 
 
 		 591 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  24.75 
 
 		 709 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  24.68 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  23.64 
 
 		 607 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0715  HerA helicase  26.18 
 
 		 409 aa  106  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  25 
 
 		 540 aa  105  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  23.93 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  22.51 
 
 		 601 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  24.78 
 
 		 584 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  32.76 
 
 		 544 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  25.43 
 
 		 583 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  35.42 
 
 		 589 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  35.15 
 
 		 591 aa  98.2  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  35.42 
 
 		 590 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  25.56 
 
 		 628 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.76 
 
 		 714 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  25.6 
 
 		 583 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.59 
 
 		 616 aa  94.4  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  23.87 
 
 		 617 aa  94.4  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  27.56 
 
 		 709 aa  94.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  21.98 
 
 		 508 aa  92.8  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  35.71 
 
 		 599 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  30.26 
 
 		 569 aa  92  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  29.87 
 
 		 569 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  24.9 
 
 		 559 aa  90.5  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4327  hypothetical protein  47.47 
 
 		 109 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  23.95 
 
 		 561 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  24.4 
 
 		 582 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  24.83 
 
 		 579 aa  89  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  25.5 
 
 		 611 aa  88.2  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  34.08 
 
 		 674 aa  87  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  25.67 
 
 		 608 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  34.97 
 
 		 664 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  33.12 
 
 		 679 aa  84.7  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  26.48 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  34.75 
 
 		 623 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  21.91 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  29.31 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  30.43 
 
 		 594 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  23.36 
 
 		 570 aa  82.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  24.74 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  28.48 
 
 		 659 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  24.8 
 
 		 590 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.75 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  24.95 
 
 		 662 aa  80.1  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  28.48 
 
 		 670 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  32.61 
 
 		 587 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  29.13 
 
 		 693 aa  79  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  24.54 
 
 		 626 aa  77.8  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  36.21 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  34.06 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  24.11 
 
 		 679 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  29.41 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  32.76 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  22.39 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  28.22 
 
 		 496 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  34.43 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  30.15 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  36.21 
 
 		 524 aa  72  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  23.1 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  30.08 
 
 		 581 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  28.37 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  28.37 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  31.54 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  33.83 
 
 		 612 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  32.59 
 
 		 583 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  28.26 
 
 		 605 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 606 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  31.39 
 
 		 532 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  31.36 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  28.34 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  22.75 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  34.21 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  40.51 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  34.21 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  34.82 
 
 		 524 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  30.46 
 
 		 534 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 530 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  32.84 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  23.65 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  28.5 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  28.68 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  34.48 
 
 		 1065 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  34.51 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  31.43 
 
 		 580 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>