14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1887 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1887  hypothetical protein  100 
 
 
870 aa  1776    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  22.46 
 
 
1065 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  21.72 
 
 
1065 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  21.79 
 
 
902 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0817  ATPase  24.28 
 
 
1039 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.331244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0832  hypothetical protein  24.28 
 
 
1037 aa  84  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842823  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  20.89 
 
 
1090 aa  72  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  20.79 
 
 
1040 aa  69.3  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  19.13 
 
 
989 aa  63.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  18.77 
 
 
1034 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  17.99 
 
 
1143 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  22.57 
 
 
930 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  21.57 
 
 
911 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  18.12 
 
 
1097 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>