44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1250 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  100 
 
 		 1040 aa  2058    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  30.48 
 
 		 902 aa  360  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0817  ATPase  34.16 
 
 		 1039 aa  291  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.331244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0832  hypothetical protein  34.16 
 
 		 1037 aa  290  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842823  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  37.97 
 
 		 1065 aa  269  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  38.79 
 
 		 989 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  37.55 
 
 		 1065 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  36.15 
 
 		 1034 aa  260  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  37.7 
 
 		 989 aa  258  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  38 
 
 		 1097 aa  253  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  37.82 
 
 		 1143 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  32.94 
 
 		 930 aa  232  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  34.44 
 
 		 911 aa  229  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  29.6 
 
 		 1090 aa  215  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1887  hypothetical protein  21.45 
 
 		 870 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  28.81 
 
 		 533 aa  63.5  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  21.47 
 
 		 540 aa  62  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  23.23 
 
 		 523 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  31.97 
 
 		 574 aa  56.2  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  21.49 
 
 		 557 aa  55.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  31.15 
 
 		 567 aa  54.7  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  23.63 
 
 		 605 aa  54.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  22.6 
 
 		 570 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  25.36 
 
 		 616 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  30.5 
 
 		 674 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  23.94 
 
 		 523 aa  52.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  25.24 
 
 		 611 aa  50.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  25.12 
 
 		 608 aa  51.2  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  27.82 
 
 		 595 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1698 aa  48.9  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.79 
 
 		 508 aa  48.9  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  26.34 
 
 		 445 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  19.85 
 
 		 1106 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  24.11 
 
 		 325 aa  47.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  28.23 
 
 		 591 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  24.64 
 
 		 1100 aa  47.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  28.4 
 
 		 606 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  28.24 
 
 		 427 aa  47.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  29.55 
 
 		 709 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  30 
 
 		 600 aa  47  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  24.55 
 
 		 643 aa  45.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  22.45 
 
 		 593 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.27 
 
 		 714 aa  45.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2056  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  37.8 
 
 		 552 aa  44.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>