206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0358 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  78.95 
 
 		 611 aa  1007    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1212    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  79.28 
 
 		 608 aa  1000    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  76.62 
 
 		 616 aa  983    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  35.86 
 
 		 628 aa  380  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  35.47 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  31.28 
 
 		 557 aa  242  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  31.82 
 
 		 496 aa  219  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  29.64 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  28.89 
 
 		 497 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  29.08 
 
 		 497 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  32.81 
 
 		 496 aa  205  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  28.39 
 
 		 493 aa  203  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  30.73 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  28.71 
 
 		 492 aa  181  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  27.65 
 
 		 557 aa  170  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  27.26 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  30.8 
 
 		 559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  27.89 
 
 		 524 aa  140  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  36.11 
 
 		 564 aa  139  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  26.55 
 
 		 561 aa  137  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  27.21 
 
 		 591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  27.91 
 
 		 523 aa  135  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  39.11 
 
 		 560 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  28.18 
 
 		 524 aa  134  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  36.26 
 
 		 559 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  36.36 
 
 		 500 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.8 
 
 		 581 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  26 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  36.21 
 
 		 524 aa  120  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  35.03 
 
 		 563 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  34.08 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  24.64 
 
 		 546 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  25.76 
 
 		 593 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  25.06 
 
 		 569 aa  110  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  25.73 
 
 		 579 aa  110  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  27.56 
 
 		 617 aa  107  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  34.76 
 
 		 587 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  31.68 
 
 		 594 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  23.37 
 
 		 595 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  26.12 
 
 		 612 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  38.65 
 
 		 659 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  36.25 
 
 		 583 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  21.81 
 
 		 607 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  36.25 
 
 		 583 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  36.25 
 
 		 584 aa  98.2  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  34.38 
 
 		 590 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  35.62 
 
 		 628 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  34.22 
 
 		 670 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  35 
 
 		 582 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  31.14 
 
 		 544 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  25.61 
 
 		 626 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  32.86 
 
 		 617 aa  94.7  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  29.24 
 
 		 360 aa  93.6  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  25.48 
 
 		 570 aa  93.6  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  29.28 
 
 		 510 aa  92.8  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  37.61 
 
 		 583 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  30.69 
 
 		 577 aa  91.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  31.46 
 
 		 591 aa  92  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  32.6 
 
 		 679 aa  91.3  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  24.28 
 
 		 532 aa  90.9  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  31.79 
 
 		 674 aa  90.5  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  27.25 
 
 		 530 aa  90.5  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  27.25 
 
 		 530 aa  90.1  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  25.67 
 
 		 572 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  27.81 
 
 		 603 aa  90.1  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  32.32 
 
 		 569 aa  89.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  27.68 
 
 		 601 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  25.64 
 
 		 530 aa  88.2  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  27.4 
 
 		 1046 aa  87  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  24.16 
 
 		 579 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  30.63 
 
 		 664 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  30.77 
 
 		 599 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  32.69 
 
 		 550 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  25.65 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  24.94 
 
 		 569 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  24.61 
 
 		 643 aa  84.7  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  31.85 
 
 		 662 aa  84.7  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  24.94 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  23.82 
 
 		 540 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  30.59 
 
 		 506 aa  83.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  31.93 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  29.53 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  28.05 
 
 		 709 aa  82  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  26.78 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  31.85 
 
 		 679 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  31.48 
 
 		 693 aa  80.9  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  33.96 
 
 		 714 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  31.85 
 
 		 674 aa  80.9  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  24.75 
 
 		 600 aa  80.5  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.76 
 
 		 623 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  23.33 
 
 		 579 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  40.4 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  25.23 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  24.83 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  23.39 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  29.47 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  24.38 
 
 		 592 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  24.53 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  25.56 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>