157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1044 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  100 
 
 		 674 aa  1381    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  52.51 
 
 		 664 aa  698    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  28.13 
 
 		 659 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  28.67 
 
 		 709 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  26.22 
 
 		 670 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  26.17 
 
 		 714 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  26.36 
 
 		 617 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  24.53 
 
 		 607 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  33.83 
 
 		 577 aa  143  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  31.11 
 
 		 579 aa  142  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  31.63 
 
 		 579 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  30.35 
 
 		 550 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  35.04 
 
 		 594 aa  137  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  34.15 
 
 		 595 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  35.91 
 
 		 546 aa  132  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  35.82 
 
 		 587 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  34.35 
 
 		 591 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  32.47 
 
 		 575 aa  123  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  35.61 
 
 		 623 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  38.64 
 
 		 601 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  37.08 
 
 		 603 aa  115  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  32.61 
 
 		 593 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  38.41 
 
 		 709 aa  111  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  29.52 
 
 		 693 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  35.33 
 
 		 679 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  35.1 
 
 		 590 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  30.71 
 
 		 583 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  30.36 
 
 		 583 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  35.9 
 
 		 544 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  35.43 
 
 		 591 aa  101  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  30.71 
 
 		 582 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  30.19 
 
 		 674 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  34.3 
 
 		 617 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  34.3 
 
 		 584 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  30.31 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  28.98 
 
 		 569 aa  99.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  33.61 
 
 		 570 aa  99.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  28.85 
 
 		 679 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  31.68 
 
 		 599 aa  98.2  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  37.04 
 
 		 616 aa  97.4  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  29.82 
 
 		 569 aa  97.1  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  42.86 
 
 		 583 aa  95.1  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  35.85 
 
 		 612 aa  94  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  31.94 
 
 		 608 aa  94  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  30.11 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  24.29 
 
 		 574 aa  93.6  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  28.45 
 
 		 662 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  29.58 
 
 		 560 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  32.72 
 
 		 611 aa  91.3  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  28.04 
 
 		 626 aa  90.9  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  31.79 
 
 		 605 aa  90.5  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  26.44 
 
 		 497 aa  90.5  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.09 
 
 		 493 aa  89.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  32.3 
 
 		 492 aa  89  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  25.96 
 
 		 497 aa  88.6  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  25.96 
 
 		 497 aa  88.6  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  29.61 
 
 		 563 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  34.08 
 
 		 600 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  32.35 
 
 		 526 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  29.38 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  39.53 
 
 		 590 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  27.57 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  39.26 
 
 		 589 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  34.03 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  31.76 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  36.51 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  30.3 
 
 		 557 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  31.87 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  28.05 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  32.26 
 
 		 570 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  30.25 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  27.12 
 
 		 561 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  29.23 
 
 		 564 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  36.44 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  27.07 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  27.31 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0340  ATPase-like protein  31.12 
 
 		 359 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  29.49 
 
 		 567 aa  74.7  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  32.65 
 
 		 531 aa  73.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  33.86 
 
 		 523 aa  72  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  32.74 
 
 		 628 aa  72.4  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  33.61 
 
 		 360 aa  72  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  29.55 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  28.3 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  23.53 
 
 		 510 aa  67  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  32.8 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  32.61 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0213  hypothetical protein  28.12 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0846575  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  32.12 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  31.45 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  34.75 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  30.72 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  30.65 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  30.65 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  32.28 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  29.95 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  33.05 
 
 		 524 aa  60.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  23.96 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  28.57 
 
 		 659 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>