139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1619 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1095    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  61.92 
 
 		 540 aa  679    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  56.07 
 
 		 530 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  43.84 
 
 		 495 aa  398  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  44.02 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  28.16 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  30.04 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  26.98 
 
 		 542 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  26.07 
 
 		 579 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  26.28 
 
 		 534 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  26.46 
 
 		 579 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  25 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  25.59 
 
 		 572 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  25.53 
 
 		 568 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.28 
 
 		 605 aa  94  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  22.54 
 
 		 497 aa  94  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.72 
 
 		 500 aa  92.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  24.76 
 
 		 580 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  23.36 
 
 		 496 aa  91.3  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  22.86 
 
 		 563 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  25.41 
 
 		 569 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  25.41 
 
 		 569 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  21.28 
 
 		 497 aa  88.2  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  21.7 
 
 		 493 aa  87  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  23.24 
 
 		 561 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  22.1 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  23.76 
 
 		 538 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  22.6 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  22.22 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  24.59 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  22.47 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  22.69 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  22.66 
 
 		 539 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.51 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  22.8 
 
 		 611 aa  82  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  24.03 
 
 		 560 aa  82  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.77 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.11 
 
 		 496 aa  80.1  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  22.89 
 
 		 599 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  22.3 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  28.57 
 
 		 679 aa  76.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  24.61 
 
 		 700 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  24.1 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  25.2 
 
 		 708 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  28.14 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  23.36 
 
 		 591 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  23.57 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  32.48 
 
 		 709 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  31.58 
 
 		 623 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  22 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.19 
 
 		 564 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  28.28 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  30 
 
 		 600 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  26.35 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  29.5 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  23.02 
 
 		 591 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  29.27 
 
 		 557 aa  67  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  22.91 
 
 		 540 aa  67  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.19 
 
 		 559 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  22.47 
 
 		 554 aa  67  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  27.11 
 
 		 709 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  29.52 
 
 		 594 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  28.02 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  28.03 
 
 		 608 aa  65.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  23.71 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  27.27 
 
 		 587 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.2 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  24.68 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  23.96 
 
 		 674 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  20.19 
 
 		 581 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  25.57 
 
 		 569 aa  62  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  21.65 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  23.06 
 
 		 662 aa  60.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  24.6 
 
 		 674 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  23.1 
 
 		 693 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  18.52 
 
 		 607 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  36.9 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  30.08 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  31.75 
 
 		 582 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 523 aa  57  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  25.43 
 
 		 567 aa  57  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  20.28 
 
 		 589 aa  57  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  27.27 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  32.74 
 
 		 583 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  31.18 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  31.86 
 
 		 617 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  32.54 
 
 		 628 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  30.97 
 
 		 583 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  31.54 
 
 		 584 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  21.27 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  23.08 
 
 		 574 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  31.43 
 
 		 524 aa  55.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.48 
 
 		 523 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  33.94 
 
 		 612 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  32.04 
 
 		 605 aa  54.3  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  22.44 
 
 		 595 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2787  hypothetical protein  25.44 
 
 		 624 aa  54.7  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  21.72 
 
 		 577 aa  54.7  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  31.86 
 
 		 583 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  30.33 
 
 		 679 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>