121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_268 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  98.87 
 
 		 530 aa  1070    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1082    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  96.23 
 
 		 530 aa  1052    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  49.07 
 
 		 538 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  48.14 
 
 		 539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  45.07 
 
 		 579 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  45.99 
 
 		 572 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  45.13 
 
 		 580 aa  480  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  44.72 
 
 		 579 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  47.31 
 
 		 534 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  46.51 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  45.57 
 
 		 568 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  44.24 
 
 		 569 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  44.24 
 
 		 569 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  43.55 
 
 		 553 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  36.42 
 
 		 554 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  23.72 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.25 
 
 		 605 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  27.2 
 
 		 608 aa  89.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  24.11 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  27.11 
 
 		 611 aa  81.3  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  21.98 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  30 
 
 		 570 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.28 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  25.34 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  23.81 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  22.42 
 
 		 583 aa  73.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  21.14 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  22.59 
 
 		 617 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  22.91 
 
 		 539 aa  73.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.19 
 
 		 616 aa  73.2  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.89 
 
 		 559 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  22.73 
 
 		 628 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  30.36 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  23.5 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  25 
 
 		 605 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  22.29 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  24.55 
 
 		 581 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  38.26 
 
 		 599 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  24.49 
 
 		 559 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  20.82 
 
 		 612 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  21.32 
 
 		 563 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  24.77 
 
 		 557 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  22.73 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  34.75 
 
 		 591 aa  66.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  29.66 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  21.94 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  21.12 
 
 		 583 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.43 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  24.16 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  36.61 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  37.84 
 
 		 623 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  33.81 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  22.57 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  31.75 
 
 		 679 aa  62.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  32.89 
 
 		 709 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  25.29 
 
 		 643 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.02 
 
 		 500 aa  62  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  31.51 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  21.23 
 
 		 584 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  31.93 
 
 		 659 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  36 
 
 		 628 aa  62  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  24.15 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  34.55 
 
 		 709 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  31.58 
 
 		 670 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  32.17 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  22.2 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  30.65 
 
 		 674 aa  61.6  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  29.63 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  28.93 
 
 		 674 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  22.87 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  30 
 
 		 679 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  21.26 
 
 		 583 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  23.74 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  26.17 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  30.5 
 
 		 664 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  29.94 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  32.39 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  35.4 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  21.55 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  24.01 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  30.91 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  35.78 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  30.36 
 
 		 603 aa  57  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  23.08 
 
 		 783 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  20.62 
 
 		 708 aa  57  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  30.91 
 
 		 662 aa  57  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.77 
 
 		 591 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  36.99 
 
 		 526 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  31.62 
 
 		 587 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  35.87 
 
 		 606 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  32.14 
 
 		 617 aa  54.3  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  28.35 
 
 		 607 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  21.83 
 
 		 497 aa  53.5  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  30.63 
 
 		 601 aa  53.5  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  30.87 
 
 		 550 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  26.09 
 
 		 714 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  32.17 
 
 		 593 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  28.18 
 
 		 693 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>