141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1515 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  100 
 
 
530 aa  1090    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  54.14 
 
 
540 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  55.51 
 
 
532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  47.67 
 
 
495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  41.76 
 
 
546 aa  353  5e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  29.28 
 
 
499 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  25.61 
 
 
542 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  24.64 
 
 
539 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.88 
 
 
628 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  25 
 
 
579 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  23.53 
 
 
563 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  24.94 
 
 
580 aa  94.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  23.11 
 
 
579 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  24.82 
 
 
496 aa  92.8  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  26.98 
 
 
497 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  22.79 
 
 
510 aa  92.8  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  24.94 
 
 
569 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  24.94 
 
 
569 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  26.38 
 
 
497 aa  90.9  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  24.62 
 
 
493 aa  90.5  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  23.19 
 
 
539 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  26.38 
 
 
497 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  24.24 
 
 
538 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.11 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  23.7 
 
 
520 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  26.58 
 
 
560 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  24.76 
 
 
568 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  23.81 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  25.06 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.07 
 
 
531 aa  84  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  22.15 
 
 
572 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  24.75 
 
 
599 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  25.13 
 
 
523 aa  80.1  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  24.51 
 
 
534 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.56 
 
 
557 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.61 
 
 
508 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  25.85 
 
 
523 aa  78.6  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  24.61 
 
 
524 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  30.6 
 
 
679 aa  75.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  21.38 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  21.14 
 
 
530 aa  73.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  24.75 
 
 
693 aa  73.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  22.04 
 
 
530 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  35.34 
 
 
591 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  28.57 
 
 
559 aa  70.9  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  25.82 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  24.43 
 
 
674 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  34.23 
 
 
623 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  23.24 
 
 
544 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  22.88 
 
 
524 aa  70.1  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  27.66 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  22.9 
 
 
616 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  28.3 
 
 
674 aa  68.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  24.69 
 
 
679 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  22.74 
 
 
492 aa  67  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  22.4 
 
 
540 aa  66.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  22.22 
 
 
524 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  24.09 
 
 
700 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  21.99 
 
 
581 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  22.4 
 
 
587 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  23.18 
 
 
569 aa  65.1  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  32.14 
 
 
709 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  24.19 
 
 
537 aa  63.9  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  22.59 
 
 
557 aa  63.9  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  31.75 
 
 
593 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.52 
 
 
709 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  22.78 
 
 
608 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.8 
 
 
559 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  24.02 
 
 
554 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  23.19 
 
 
575 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  22.22 
 
 
1090 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 
600 aa  62  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  26.09 
 
 
605 aa  61.2  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  31.3 
 
 
594 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  31.15 
 
 
526 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  21.74 
 
 
569 aa  60.5  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  30.77 
 
 
628 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  35.78 
 
 
612 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  30 
 
 
617 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  26.49 
 
 
700 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  30.77 
 
 
583 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  28.72 
 
 
591 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  30 
 
 
583 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  22.1 
 
 
607 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  29.23 
 
 
582 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  30 
 
 
584 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  20.59 
 
 
550 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  26.29 
 
 
708 aa  57  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  23.54 
 
 
662 aa  57  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  22.37 
 
 
570 aa  57  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  20.29 
 
 
581 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  34.52 
 
 
577 aa  57  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  23.66 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  32.14 
 
 
579 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  29.23 
 
 
583 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  25.85 
 
 
611 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  24.18 
 
 
643 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  27.83 
 
 
546 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  23.41 
 
 
560 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  33.66 
 
 
626 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>