102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1440 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  100 
 
 
539 aa  1079    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  28.32 
 
 
546 aa  150  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  26.25 
 
 
499 aa  150  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  30.04 
 
 
532 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  27.37 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  26.46 
 
 
495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  24.64 
 
 
530 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  25.06 
 
 
568 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  24.78 
 
 
554 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  24.04 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  22.91 
 
 
530 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  22.87 
 
 
530 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  24.57 
 
 
579 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  25.06 
 
 
572 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  23.08 
 
 
560 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  22.91 
 
 
530 aa  70.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  23.57 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  23.57 
 
 
569 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  25.43 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  25.78 
 
 
538 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23.8 
 
 
524 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  24.26 
 
 
553 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  24.1 
 
 
496 aa  67  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  26.83 
 
 
628 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  26.4 
 
 
584 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  23.81 
 
 
561 aa  63.9  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  24.22 
 
 
534 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  21.67 
 
 
580 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  26.27 
 
 
570 aa  62  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  23.84 
 
 
523 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.54 
 
 
500 aa  61.2  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  25.42 
 
 
583 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  26.4 
 
 
582 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  25.78 
 
 
583 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  23.68 
 
 
579 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  32.08 
 
 
605 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  22.93 
 
 
563 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.17 
 
 
559 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.51 
 
 
531 aa  57.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  23.99 
 
 
604 aa  57.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  23.5 
 
 
625 aa  57.4  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  25.63 
 
 
617 aa  57  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  21.04 
 
 
708 aa  57  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  32.61 
 
 
569 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  25.71 
 
 
583 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  22.39 
 
 
783 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1098  hypothetical protein  38.46 
 
 
521 aa  55.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  29.41 
 
 
600 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  24.11 
 
 
581 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  25.27 
 
 
700 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  23.23 
 
 
605 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  41.89 
 
 
591 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  23.33 
 
 
581 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  34.15 
 
 
599 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  23.2 
 
 
628 aa  54.7  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  29.14 
 
 
608 aa  54.7  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  37.84 
 
 
526 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  29.68 
 
 
616 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  21.67 
 
 
700 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  37.04 
 
 
544 aa  53.9  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  25.11 
 
 
570 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  32.38 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  28.93 
 
 
611 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  22.47 
 
 
600 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.901274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  30.36 
 
 
508 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  24.41 
 
 
577 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1658  hypothetical protein  23.18 
 
 
604 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208487  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0611  ATPase-like protein  31.78 
 
 
618 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  38.55 
 
 
569 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2277  hypothetical protein  30.84 
 
 
653 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  32.69 
 
 
623 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  29.45 
 
 
659 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  24.31 
 
 
670 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2787  hypothetical protein  26.67 
 
 
624 aa  50.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  31.73 
 
 
617 aa  50.8  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  30.25 
 
 
579 aa  50.4  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  33.65 
 
 
594 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3942  hypothetical protein  23.94 
 
 
721 aa  50.4  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.222103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  32.71 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.48 
 
 
591 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  32.2 
 
 
679 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  29.81 
 
 
709 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  29.19 
 
 
606 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  30.77 
 
 
567 aa  48.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  27.41 
 
 
524 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  31.9 
 
 
524 aa  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  29.27 
 
 
593 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  27.61 
 
 
523 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  22.32 
 
 
564 aa  47.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  32.17 
 
 
574 aa  47.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  29.93 
 
 
492 aa  47  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  28.97 
 
 
587 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  31.71 
 
 
557 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  30.4 
 
 
557 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  33.66 
 
 
693 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  29.81 
 
 
595 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  30.1 
 
 
540 aa  44.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  39.71 
 
 
520 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  29.56 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  39.71 
 
 
674 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>