117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1625 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  100 
 
 		 783 aa  1604    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  66.72 
 
 		 605 aa  811    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1658  hypothetical protein  43.53 
 
 		 604 aa  527  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0611  ATPase-like protein  47.6 
 
 		 618 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  43.77 
 
 		 625 aa  510  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  44.93 
 
 		 604 aa  510  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2277  hypothetical protein  44.95 
 
 		 653 aa  504  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2787  hypothetical protein  29.15 
 
 		 624 aa  256  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  25.07 
 
 		 569 aa  75.1  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  26.46 
 
 		 599 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  24.53 
 
 		 544 aa  72  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  28.78 
 
 		 651 aa  70.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 591 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  32.43 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.33 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  21.58 
 
 		 570 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  22.38 
 
 		 569 aa  65.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  24.05 
 
 		 496 aa  63.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  27.91 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  39.24 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  22.31 
 
 		 628 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  22.16 
 
 		 584 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  24.01 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  21.88 
 
 		 583 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  28.77 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.33 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1098  hypothetical protein  21.22 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  31.43 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  21.76 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 617 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  23.08 
 
 		 530 aa  57  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  23.08 
 
 		 530 aa  57  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  22.22 
 
 		 709 aa  57.4  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  30.15 
 
 		 500 aa  56.2  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 570 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  26.28 
 
 		 520 aa  56.6  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  24.94 
 
 		 581 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.17 
 
 		 560 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  22.39 
 
 		 539 aa  55.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  21.25 
 
 		 612 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  21.87 
 
 		 693 aa  55.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  38.16 
 
 		 554 aa  55.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  25.9 
 
 		 540 aa  55.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  23.19 
 
 		 550 aa  55.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  34.95 
 
 		 606 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.24 
 
 		 628 aa  55.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  31.07 
 
 		 679 aa  55.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0715  HerA helicase  22.34 
 
 		 409 aa  55.1  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  31.15 
 
 		 709 aa  54.7  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  29.46 
 
 		 600 aa  54.7  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  22.04 
 
 		 583 aa  55.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  22.73 
 
 		 508 aa  54.3  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  22 
 
 		 557 aa  54.3  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  28.74 
 
 		 575 aa  53.9  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  29.31 
 
 		 600 aa  53.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.901274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  22.35 
 
 		 583 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  31.07 
 
 		 540 aa  53.5  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  26.09 
 
 		 609 aa  52.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  28.16 
 
 		 643 aa  52.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  22.35 
 
 		 623 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  26.92 
 
 		 564 aa  52.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  20.34 
 
 		 607 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  23.56 
 
 		 579 aa  51.6  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 594 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  22.35 
 
 		 557 aa  51.6  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  28.44 
 
 		 587 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  28.99 
 
 		 567 aa  51.2  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  23.32 
 
 		 524 aa  51.2  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  25.14 
 
 		 523 aa  51.2  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  24.18 
 
 		 530 aa  51.2  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  29.36 
 
 		 744 aa  50.8  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  33.67 
 
 		 579 aa  50.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2074  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.52 
 
 		 526 aa  50.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504817  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  34.78 
 
 		 532 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1512  AAA ATPase  29.94 
 
 		 595 aa  50.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000264338  normal  0.723812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  30.39 
 
 		 714 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  30.23 
 
 		 546 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  22.33 
 
 		 1090 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  25.66 
 
 		 496 aa  49.7  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  21.07 
 
 		 590 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  28.16 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  30.56 
 
 		 595 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0786  hypothetical protein  23.03 
 
 		 511 aa  49.3  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0655509  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  28.39 
 
 		 674 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  30.77 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  22.47 
 
 		 524 aa  48.9  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3204  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  20.59 
 
 		 507 aa  48.5  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  30.88 
 
 		 492 aa  48.5  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  30.12 
 
 		 559 aa  48.1  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  30.67 
 
 		 662 aa  47.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  34.78 
 
 		 495 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  31.91 
 
 		 579 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3520  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.64 
 
 		 508 aa  47.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227605  normal  0.161748 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1145  AAA ATPase  28.42 
 
 		 533 aa  47  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00264126  hitchhiker  0.0000264348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  25.24 
 
 		 538 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  27.1 
 
 		 593 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  22.26 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  22.56 
 
 		 523 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  26.47 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  32.91 
 
 		 537 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>