177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0252 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  100 
 
 		 537 aa  1076    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  34.6 
 
 		 744 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  33.46 
 
 		 595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  33.59 
 
 		 580 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  33.2 
 
 		 655 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  33.06 
 
 		 659 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  27.84 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  30.42 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  29.66 
 
 		 500 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  27.76 
 
 		 499 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  27.46 
 
 		 499 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  26.71 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  28.91 
 
 		 516 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  29.28 
 
 		 498 aa  98.6  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  28.52 
 
 		 507 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  29.53 
 
 		 504 aa  97.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  29.69 
 
 		 502 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  29.07 
 
 		 504 aa  97.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  28.62 
 
 		 506 aa  96.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  29.15 
 
 		 503 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  29.89 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  27 
 
 		 513 aa  95.9  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  29.15 
 
 		 504 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  27.1 
 
 		 511 aa  95.1  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  29.56 
 
 		 498 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  27.73 
 
 		 514 aa  93.6  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  28.04 
 
 		 490 aa  93.6  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  30.46 
 
 		 526 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  25.6 
 
 		 510 aa  90.9  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  29.1 
 
 		 498 aa  87.4  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  27.94 
 
 		 504 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  32.83 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  32.58 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  35.03 
 
 		 524 aa  77.4  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  31.65 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  34.18 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  32.74 
 
 		 524 aa  73.2  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  35.64 
 
 		 579 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  27.9 
 
 		 608 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  27.9 
 
 		 608 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  30.36 
 
 		 595 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  29.76 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  27.15 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  34.06 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  33.12 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  38.6 
 
 		 550 aa  63.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  32.87 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  35.51 
 
 		 599 aa  62  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  33.81 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  37.76 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  32.03 
 
 		 611 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  28.4 
 
 		 1076 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  37.5 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  30.34 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  36.17 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  37.66 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  34.23 
 
 		 605 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  31.97 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  33.09 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  33.09 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  30.65 
 
 		 581 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  30.6 
 
 		 603 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  26.92 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  26.92 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  38.96 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  36.46 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  32.43 
 
 		 608 aa  58.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  36.11 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  41.56 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  30.23 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  31.82 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  38.1 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  36.96 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  37.66 
 
 		 670 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 500 aa  57  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  30.65 
 
 		 709 aa  57  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 579 aa  57  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  31.4 
 
 		 591 aa  57  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  36.36 
 
 		 709 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  38.03 
 
 		 591 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  33.08 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  36.17 
 
 		 569 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  27.43 
 
 		 617 aa  54.7  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  31.53 
 
 		 616 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  29.46 
 
 		 664 aa  55.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  43.55 
 
 		 559 aa  54.3  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  23.31 
 
 		 623 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  32.1 
 
 		 526 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  28.4 
 
 		 601 aa  53.9  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  37.66 
 
 		 546 aa  53.5  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1098  hypothetical protein  31.53 
 
 		 521 aa  53.5  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  34.82 
 
 		 643 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  40.62 
 
 		 607 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  25.74 
 
 		 1071 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  35.37 
 
 		 674 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  39.24 
 
 		 534 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  28.19 
 
 		 575 aa  51.2  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  26.4 
 
 		 559 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  36.99 
 
 		 605 aa  50.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>