140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5533 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1205    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1205    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.87 
 
 
580 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  23.17 
 
 
659 aa  94.7  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  25.98 
 
 
655 aa  90.1  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.01 
 
 
744 aa  86.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  26.67 
 
 
595 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  31.5 
 
 
250 aa  83.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  27.9 
 
 
537 aa  78.2  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  33.04 
 
 
546 aa  61.6  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  30.88 
 
 
520 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  37.96 
 
 
496 aa  60.8  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  30.05 
 
 
500 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  35.82 
 
 
577 aa  60.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  40.48 
 
 
508 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  39.62 
 
 
559 aa  59.3  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  31.3 
 
 
591 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  28.4 
 
 
506 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  28.57 
 
 
531 aa  58.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  27.46 
 
 
511 aa  57.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  34.78 
 
 
550 aa  57.4  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  28.35 
 
 
504 aa  57.4  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  26.74 
 
 
599 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  26.54 
 
 
513 aa  56.6  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  34.08 
 
 
510 aa  57  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  26.92 
 
 
514 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  32.1 
 
 
591 aa  56.6  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  28.29 
 
 
503 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  32.39 
 
 
498 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  28.29 
 
 
504 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  31.09 
 
 
595 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  31.67 
 
 
679 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  26.21 
 
 
511 aa  54.7  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  27.75 
 
 
510 aa  54.7  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  32.14 
 
 
579 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  31.25 
 
 
603 aa  54.3  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  32 
 
 
490 aa  54.3  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  27.63 
 
 
507 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  27.05 
 
 
499 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.83 
 
 
523 aa  53.9  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 
492 aa  53.9  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  27.49 
 
 
498 aa  53.9  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  27.05 
 
 
499 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  28.4 
 
 
516 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  29.18 
 
 
502 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  36 
 
 
557 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  30.63 
 
 
594 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  27.05 
 
 
500 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  31.11 
 
 
579 aa  53.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  26.72 
 
 
607 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  30.97 
 
 
557 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  27.91 
 
 
496 aa  53.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  27.59 
 
 
526 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  32.69 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  30 
 
 
608 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  29.27 
 
 
611 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  38.46 
 
 
670 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  30 
 
 
605 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  35.9 
 
 
659 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  24.91 
 
 
504 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  39.13 
 
 
544 aa  51.2  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  27.05 
 
 
497 aa  51.2  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  27.05 
 
 
497 aa  51.2  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.55 
 
 
493 aa  50.8  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2109  protein of unknown function DUF87  22.9 
 
 
688 aa  50.4  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000368581  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  33.03 
 
 
569 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  28.51 
 
 
498 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  31.25 
 
 
524 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  27.05 
 
 
497 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  28.44 
 
 
616 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  27.23 
 
 
524 aa  50.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  30.91 
 
 
563 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  31.13 
 
 
427 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  27.43 
 
 
492 aa  49.7  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3852  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  43.4 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  27.44 
 
 
617 aa  48.9  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  26.53 
 
 
587 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  23.03 
 
 
605 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1108  AAA ATPase  28.87 
 
 
534 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00107728  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  26.67 
 
 
592 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1145  AAA ATPase  30.61 
 
 
533 aa  48.9  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00264126  hitchhiker  0.0000264348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  26.89 
 
 
604 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  34.91 
 
 
651 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  30.46 
 
 
623 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  28.95 
 
 
714 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  29.94 
 
 
504 aa  47.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  31.13 
 
 
520 aa  47.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.97 
 
 
581 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 
500 aa  47.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.16 
 
 
593 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4584  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  40.35 
 
 
508 aa  47.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  28.89 
 
 
709 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  28.91 
 
 
601 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  25.23 
 
 
625 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  29.94 
 
 
664 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  30.36 
 
 
600 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  34.18 
 
 
579 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  26.67 
 
 
589 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  29.46 
 
 
662 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  27.52 
 
 
590 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>