67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2167 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  100 
 
 		 507 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  87.62 
 
 		 516 aa  881    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  81.23 
 
 		 502 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  86.49 
 
 		 504 aa  857    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  88.36 
 
 		 506 aa  895    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  77.15 
 
 		 498 aa  735    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  63.04 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  62.16 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  63.77 
 
 		 498 aa  585  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  64.26 
 
 		 514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  64.11 
 
 		 511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  62.7 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  59.92 
 
 		 526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  61.48 
 
 		 510 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  60.64 
 
 		 503 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  59.48 
 
 		 504 aa  552  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  61.28 
 
 		 504 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  60.29 
 
 		 498 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  61.37 
 
 		 520 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  59.55 
 
 		 500 aa  525  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  59.35 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  59.55 
 
 		 499 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  56.88 
 
 		 490 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  53.48 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  54.38 
 
 		 504 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  28.52 
 
 		 537 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.64 
 
 		 744 aa  64.7  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  27.82 
 
 		 595 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.74 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  26.27 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.65 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  27.11 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  26.29 
 
 		 659 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  28.31 
 
 		 524 aa  53.5  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.56 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  27.97 
 
 		 524 aa  50.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  29.31 
 
 		 1076 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  30.84 
 
 		 582 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  27.17 
 
 		 608 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  31.44 
 
 		 645 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  27.17 
 
 		 608 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  27.27 
 
 		 611 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  28.31 
 
 		 524 aa  47.4  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  30.08 
 
 		 574 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  28.1 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.52 
 
 		 581 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  29.87 
 
 		 1104 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  26.32 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1233  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  44.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.616715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  23.46 
 
 		 557 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  28.37 
 
 		 579 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  25.95 
 
 		 567 aa  44.3  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  26.17 
 
 		 560 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  25.64 
 
 		 577 aa  44.3  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 550 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  27.23 
 
 		 1107 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.23 
 
 		 908 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  35.21 
 
 		 570 aa  43.9  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  25.45 
 
 		 608 aa  43.9  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.23 
 
 		 908 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  27.43 
 
 		 664 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  34.71 
 
 		 572 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  27.81 
 
 		 600 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.17 
 
 		 605 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.09 
 
 		 1174 aa  43.5  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 554 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 554 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>