32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0756 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  100 
 
 		 645 aa  1311    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  27.95 
 
 		 686 aa  60.8  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  32.47 
 
 		 504 aa  51.2  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  33.16 
 
 		 500 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  24.39 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  26.98 
 
 		 526 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  31.11 
 
 		 503 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  31.79 
 
 		 506 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  30.04 
 
 		 511 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  32.81 
 
 		 499 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  32.81 
 
 		 499 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  31.44 
 
 		 507 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  30.54 
 
 		 516 aa  47.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  31.25 
 
 		 599 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  36.23 
 
 		 508 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  31.11 
 
 		 504 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  42 
 
 		 569 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  28.19 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  31.98 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  37.31 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  28.19 
 
 		 514 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  28.19 
 
 		 511 aa  45.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0720  hypothetical protein  28.74 
 
 		 351 aa  45.4  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  29.78 
 
 		 492 aa  45.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  32.05 
 
 		 496 aa  44.3  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4789  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  35.34 
 
 		 514 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  30.61 
 
 		 498 aa  44.3  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  35 
 
 		 288 aa  44.3  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  32.64 
 
 		 498 aa  44.3  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  30.69 
 
 		 510 aa  43.9  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  21.23 
 
 		 493 aa  43.9  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  28.12 
 
 		 490 aa  43.9  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>