288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1296 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  100 
 
 
599 aa  1239    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  41.13 
 
 
679 aa  458  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  37.58 
 
 
593 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  40.24 
 
 
709 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  37.26 
 
 
623 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  37.62 
 
 
591 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  39.13 
 
 
526 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  30.17 
 
 
569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  29.98 
 
 
575 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  30.68 
 
 
569 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  29.19 
 
 
544 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  28.4 
 
 
546 aa  210  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  24.96 
 
 
550 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  27.91 
 
 
583 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  31.49 
 
 
559 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  28.55 
 
 
628 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  26.23 
 
 
612 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  27.43 
 
 
582 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  29.12 
 
 
590 aa  189  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  27.38 
 
 
693 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  28.08 
 
 
583 aa  187  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.63 
 
 
591 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  26.31 
 
 
584 aa  184  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  27.18 
 
 
607 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  27.9 
 
 
570 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  24.96 
 
 
617 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  30.78 
 
 
662 aa  180  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  26.09 
 
 
674 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  25.6 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  25.75 
 
 
679 aa  170  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  27.59 
 
 
579 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  25.91 
 
 
595 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  27 
 
 
560 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  26.28 
 
 
577 aa  164  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  27.45 
 
 
626 aa  163  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  27.03 
 
 
587 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  25.25 
 
 
594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  27.9 
 
 
579 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  26.61 
 
 
563 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  27.06 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  25.38 
 
 
570 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  33 
 
 
709 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  26.68 
 
 
520 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  32.3 
 
 
714 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  27.49 
 
 
427 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  26.9 
 
 
561 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  32.39 
 
 
492 aa  103  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  33.13 
 
 
500 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  33.33 
 
 
603 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  30.32 
 
 
664 aa  98.2  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  31.68 
 
 
674 aa  98.2  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  40.13 
 
 
531 aa  97.4  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  24.77 
 
 
567 aa  97.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  30.51 
 
 
496 aa  97.1  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  31.31 
 
 
601 aa  97.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.59 
 
 
628 aa  95.1  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  35.8 
 
 
557 aa  94.7  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  35.71 
 
 
600 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  30.48 
 
 
497 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  32.33 
 
 
510 aa  92  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  30.48 
 
 
497 aa  92  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  29.51 
 
 
659 aa  91.3  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  32.48 
 
 
560 aa  90.5  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  30.99 
 
 
497 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  30.86 
 
 
564 aa  89.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  30.43 
 
 
493 aa  90.1  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  31.58 
 
 
617 aa  90.1  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  23.2 
 
 
590 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.65 
 
 
581 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  30 
 
 
508 aa  88.2  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  28.27 
 
 
670 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  31.54 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  29.14 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  30.77 
 
 
605 aa  84.7  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  32.68 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  21.05 
 
 
589 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  24.75 
 
 
530 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  32.76 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  29.49 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  27.49 
 
 
557 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  33.71 
 
 
523 aa  80.9  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  36.17 
 
 
574 aa  80.5  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  33.63 
 
 
616 aa  77.4  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  35.86 
 
 
524 aa  76.6  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  22.5 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  35.9 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  32.89 
 
 
524 aa  73.6  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  26.46 
 
 
783 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  34.85 
 
 
606 aa  70.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  25.31 
 
 
516 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  38.26 
 
 
530 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  35 
 
 
546 aa  68.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  33.33 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  38.26 
 
 
530 aa  68.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  38.94 
 
 
530 aa  67.4  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  42.47 
 
 
605 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  32.45 
 
 
542 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  36.59 
 
 
553 aa  64.7  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  27.39 
 
 
506 aa  63.9  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  34.96 
 
 
534 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>