137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3526 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  80.72 
 
 		 617 aa  964    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  81.87 
 
 		 628 aa  987    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  83.39 
 
 		 583 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  82.36 
 
 		 582 aa  984    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  81.23 
 
 		 584 aa  978    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  100 
 
 		 583 aa  1190    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  57.25 
 
 		 612 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  82.38 
 
 		 583 aa  987    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  55.57 
 
 		 590 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  45.1 
 
 		 693 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  46.32 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  43.17 
 
 		 560 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  45.07 
 
 		 679 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  44.13 
 
 		 674 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  42.61 
 
 		 626 aa  432  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  40.45 
 
 		 570 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  36.85 
 
 		 544 aa  350  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  38.66 
 
 		 569 aa  349  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  36.76 
 
 		 569 aa  348  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  31.83 
 
 		 575 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  27.68 
 
 		 550 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.98 
 
 		 593 aa  213  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  29.66 
 
 		 546 aa  211  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  26.19 
 
 		 591 aa  210  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  27.29 
 
 		 623 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  28.97 
 
 		 607 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.41 
 
 		 709 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  26.84 
 
 		 594 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  25.6 
 
 		 599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  23.59 
 
 		 595 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  26.82 
 
 		 591 aa  169  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  26.92 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  27.03 
 
 		 579 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  27.13 
 
 		 577 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  29.07 
 
 		 559 aa  154  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  26.25 
 
 		 579 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  34.3 
 
 		 679 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  31.4 
 
 		 659 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  24.04 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  25.06 
 
 		 564 aa  108  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  25.86 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  31.15 
 
 		 670 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  25.5 
 
 		 559 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  33.98 
 
 		 674 aa  100  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  25.72 
 
 		 567 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  35.62 
 
 		 605 aa  98.6  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  25.17 
 
 		 608 aa  98.6  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  25.83 
 
 		 497 aa  97.8  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  33.52 
 
 		 709 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  34.55 
 
 		 611 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.62 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.43 
 
 		 714 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  27.82 
 
 		 497 aa  94  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  35 
 
 		 616 aa  93.6  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.56 
 
 		 496 aa  93.6  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  32.04 
 
 		 664 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  25 
 
 		 563 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  27.25 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  36.36 
 
 		 617 aa  89  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  26.3 
 
 		 574 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  29.44 
 
 		 603 aa  89.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  37.88 
 
 		 601 aa  87.4  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  23.88 
 
 		 600 aa  87  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  25.12 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  37.93 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  31.61 
 
 		 581 aa  84  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  31.01 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.25 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  35.29 
 
 		 628 aa  79.3  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  34.13 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  33.87 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  34.35 
 
 		 570 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  30.49 
 
 		 557 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  22.42 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  34.38 
 
 		 360 aa  73.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  22.36 
 
 		 530 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  22.03 
 
 		 530 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  38.39 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  30 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  34.15 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  34.13 
 
 		 589 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  30.51 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  24.47 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  24.42 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  32.2 
 
 		 592 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  25.56 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  38.74 
 
 		 523 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  39 
 
 		 643 aa  62  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  32.32 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  22.35 
 
 		 783 aa  61.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  23.63 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  32.03 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  26.54 
 
 		 539 aa  59.7  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  30.77 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  47.14 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  36.21 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  33.61 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  34.71 
 
 		 580 aa  57  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  33.61 
 
 		 539 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>