197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1871 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1138    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  34.82 
 
 
607 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  29.98 
 
 
575 aa  273  5.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  33.91 
 
 
546 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  31.35 
 
 
569 aa  256  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  30.02 
 
 
569 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  30.42 
 
 
628 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  29.68 
 
 
582 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  28.24 
 
 
544 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  30.52 
 
 
583 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  30.42 
 
 
583 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  31.49 
 
 
584 aa  227  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  28.79 
 
 
617 aa  225  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  29.23 
 
 
595 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  27.68 
 
 
583 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  31.58 
 
 
594 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  27.22 
 
 
570 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.14 
 
 
679 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  30.7 
 
 
590 aa  209  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  27.74 
 
 
591 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  29.38 
 
 
591 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  26.72 
 
 
593 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  29.63 
 
 
612 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  32.32 
 
 
577 aa  203  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  26.7 
 
 
623 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  30.27 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  29.83 
 
 
587 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  24.96 
 
 
599 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  29.18 
 
 
693 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.11 
 
 
709 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  32.99 
 
 
626 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  27.39 
 
 
560 aa  190  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  27.7 
 
 
579 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  29.05 
 
 
674 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  28.1 
 
 
679 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  28.51 
 
 
662 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  26.3 
 
 
559 aa  174  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  28.16 
 
 
526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  32.87 
 
 
709 aa  145  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  30.35 
 
 
674 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  32.8 
 
 
664 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  30.21 
 
 
714 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  34.68 
 
 
659 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  33.04 
 
 
670 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  25.74 
 
 
427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  25.22 
 
 
600 aa  120  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  24.72 
 
 
574 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  27.37 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  24.16 
 
 
567 aa  115  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  33.64 
 
 
617 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  26.57 
 
 
520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  25.14 
 
 
570 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.8 
 
 
524 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  24.67 
 
 
557 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  26.52 
 
 
497 aa  103  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  26.41 
 
 
497 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.32 
 
 
559 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  28 
 
 
510 aa  101  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.49 
 
 
493 aa  100  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  28.14 
 
 
496 aa  97.8  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  21.88 
 
 
564 aa  97.4  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  24.8 
 
 
560 aa  97.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  35.06 
 
 
496 aa  96.3  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  25.56 
 
 
497 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  25.57 
 
 
603 aa  96.3  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  23.33 
 
 
581 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  22.81 
 
 
508 aa  94.4  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.74 
 
 
531 aa  93.6  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  29.38 
 
 
500 aa  90.1  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  37.5 
 
 
601 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.51 
 
 
523 aa  87.8  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  34.39 
 
 
557 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  26.24 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  32.24 
 
 
605 aa  84  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  31.94 
 
 
611 aa  81.6  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  23.08 
 
 
540 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  34.13 
 
 
608 aa  80.1  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  23.46 
 
 
360 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 
744 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  33.33 
 
 
595 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  27.63 
 
 
523 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  32.87 
 
 
616 aa  78.2  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  31.91 
 
 
655 aa  78.2  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  30.41 
 
 
561 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  35.37 
 
 
589 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  31.38 
 
 
580 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  31.02 
 
 
659 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  30.49 
 
 
592 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  26.51 
 
 
589 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  32.65 
 
 
590 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  23.04 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  38.89 
 
 
643 aa  67  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  23.06 
 
 
540 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  30.43 
 
 
628 aa  63.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2109  protein of unknown function DUF87  32.5 
 
 
688 aa  63.9  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000368581  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  38.6 
 
 
537 aa  63.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  32.31 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  26.32 
 
 
533 aa  62.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  30.26 
 
 
524 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  23.81 
 
 
542 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>