200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0070 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  100 
 
 
500 aa  1014    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  64.06 
 
 
492 aa  648    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  38.78 
 
 
496 aa  320  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  36.99 
 
 
520 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  38.98 
 
 
497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  39.38 
 
 
497 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  38.97 
 
 
497 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  37.9 
 
 
493 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  33.46 
 
 
510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  30.43 
 
 
611 aa  202  8e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  30.49 
 
 
616 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.39 
 
 
628 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  31.85 
 
 
531 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  29.1 
 
 
560 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  27.35 
 
 
559 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  26.53 
 
 
523 aa  133  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  37.85 
 
 
608 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  27.08 
 
 
563 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  36.36 
 
 
605 aa  130  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  28.47 
 
 
575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  29.11 
 
 
508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.38 
 
 
524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  25.2 
 
 
524 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  25.34 
 
 
564 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  28.22 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  27.6 
 
 
546 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  26.4 
 
 
581 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  36.41 
 
 
557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  23.02 
 
 
523 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  26.7 
 
 
557 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  25.87 
 
 
569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  24.26 
 
 
524 aa  110  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  25.35 
 
 
569 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  30.53 
 
 
546 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  33.68 
 
 
559 aa  103  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  33.13 
 
 
599 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  25.95 
 
 
591 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  26.03 
 
 
570 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  39.71 
 
 
594 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  38.61 
 
 
591 aa  97.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  31.41 
 
 
679 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  26.98 
 
 
537 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  29.38 
 
 
709 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  33.33 
 
 
561 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  33.75 
 
 
623 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  24.06 
 
 
495 aa  93.2  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  26.87 
 
 
540 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  24.29 
 
 
544 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  25.26 
 
 
532 aa  91.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  33.33 
 
 
709 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  26.8 
 
 
526 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  29.38 
 
 
550 aa  90.1  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  31.67 
 
 
579 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  35.77 
 
 
587 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  25.62 
 
 
584 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  24.44 
 
 
583 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  24.94 
 
 
693 aa  87  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  31.02 
 
 
714 aa  87  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  26.26 
 
 
582 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  26.3 
 
 
617 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  24.42 
 
 
567 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  30.43 
 
 
593 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  30.81 
 
 
595 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  23.43 
 
 
570 aa  83.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  25.76 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  24.62 
 
 
579 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  35.06 
 
 
617 aa  82  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  26.06 
 
 
607 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  23.45 
 
 
540 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  27.32 
 
 
577 aa  80.5  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  26.95 
 
 
533 aa  80.5  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  25.54 
 
 
612 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  26.15 
 
 
542 aa  80.1  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  36.62 
 
 
659 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  30.39 
 
 
664 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  23.54 
 
 
643 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  23.89 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  25.25 
 
 
583 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  27.07 
 
 
674 aa  77.8  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  25.06 
 
 
499 aa  77.8  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  22.45 
 
 
582 aa  77  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  29.88 
 
 
670 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  23.75 
 
 
560 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  24.75 
 
 
662 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  24.33 
 
 
674 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  31.25 
 
 
603 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  29.58 
 
 
574 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  22.39 
 
 
600 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  25.74 
 
 
626 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  22.04 
 
 
539 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  30.34 
 
 
601 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  25 
 
 
579 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  27.66 
 
 
530 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  24.59 
 
 
579 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  33.61 
 
 
679 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  32.33 
 
 
606 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  24.72 
 
 
700 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  23.39 
 
 
553 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  23.99 
 
 
580 aa  66.6  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  29.21 
 
 
538 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>