211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1949 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1212    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  41.88 
 
 		 579 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  39.56 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  35.5 
 
 		 575 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  30.43 
 
 		 595 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  32.55 
 
 		 546 aa  236  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  29.64 
 
 		 607 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  32.14 
 
 		 594 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  30.6 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.7 
 
 		 593 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  29.79 
 
 		 569 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  26.92 
 
 		 550 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  31.93 
 
 		 623 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  29.43 
 
 		 569 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  31.67 
 
 		 679 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  28.72 
 
 		 544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  31.63 
 
 		 579 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  30.52 
 
 		 709 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  30 
 
 		 599 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  29.49 
 
 		 570 aa  174  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  28.06 
 
 		 591 aa  173  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  28.72 
 
 		 628 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  27.44 
 
 		 583 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  26.74 
 
 		 583 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  27.65 
 
 		 582 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  27.88 
 
 		 583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  27.33 
 
 		 584 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  29.94 
 
 		 526 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  26.04 
 
 		 560 aa  160  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  26.96 
 
 		 617 aa  157  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  26.13 
 
 		 693 aa  157  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  29.88 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  25.54 
 
 		 612 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  24.78 
 
 		 590 aa  151  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  27.1 
 
 		 679 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  26.42 
 
 		 574 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  26.46 
 
 		 674 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  33.91 
 
 		 664 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  27 
 
 		 567 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  24.45 
 
 		 603 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  26.71 
 
 		 662 aa  136  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  27.49 
 
 		 659 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  27.38 
 
 		 559 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  34.42 
 
 		 709 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  25.55 
 
 		 427 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  27.34 
 
 		 626 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  34.35 
 
 		 674 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  31.02 
 
 		 714 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  26.24 
 
 		 670 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  28.39 
 
 		 520 aa  113  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.15 
 
 		 493 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.71 
 
 		 531 aa  107  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  33.53 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  23.93 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.17 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.98 
 
 		 496 aa  103  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  29.38 
 
 		 601 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.95 
 
 		 500 aa  100  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  25.9 
 
 		 492 aa  100  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  25.86 
 
 		 581 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  35.15 
 
 		 600 aa  97.8  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.26 
 
 		 524 aa  97.8  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  40.74 
 
 		 611 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  30.22 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  25.33 
 
 		 523 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  31.46 
 
 		 605 aa  92  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  34.27 
 
 		 616 aa  91.7  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  38.52 
 
 		 608 aa  90.5  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.4 
 
 		 524 aa  88.2  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.07 
 
 		 564 aa  87.4  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  33.57 
 
 		 496 aa  87  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.1 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  31.76 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  34.56 
 
 		 563 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  24.15 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  29.89 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  29.73 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  30.41 
 
 		 557 aa  77  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  31.21 
 
 		 628 aa  76.6  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  29.89 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  29.52 
 
 		 592 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  29.61 
 
 		 510 aa  72  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  28.78 
 
 		 559 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  31.25 
 
 		 590 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  24.48 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  31.5 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  30.88 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  28.28 
 
 		 659 aa  68.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  33.85 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  26.15 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  28.28 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  20 
 
 		 540 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  35.53 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.59 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  23.02 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  30.34 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  24.17 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  37.38 
 
 		 643 aa  63.5  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  23.35 
 
 		 581 aa  63.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3692  protein of unknown function DUF87  25.28 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>