149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0937 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  61 
 
 
532 aa  671    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  100 
 
 
540 aa  1106    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  54.14 
 
 
530 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  43.11 
 
 
495 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  44.62 
 
 
546 aa  385  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  28.23 
 
 
499 aa  161  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  27.37 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  25.49 
 
 
538 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  26.29 
 
 
569 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  27.11 
 
 
579 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  26.29 
 
 
569 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  26 
 
 
568 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  25 
 
 
553 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.61 
 
 
496 aa  98.2  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  25.99 
 
 
572 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  23.37 
 
 
539 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  24.66 
 
 
530 aa  96.7  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  23.84 
 
 
530 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  24.77 
 
 
579 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  23.72 
 
 
530 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  24.78 
 
 
580 aa  95.1  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  24.46 
 
 
542 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  23.4 
 
 
563 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  23.38 
 
 
561 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.5 
 
 
557 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  24.94 
 
 
523 aa  83.6  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  23.09 
 
 
534 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.45 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  23.17 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  22.91 
 
 
628 aa  80.5  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  24.28 
 
 
569 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.53 
 
 
493 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  24.38 
 
 
708 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  26.11 
 
 
560 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  25.79 
 
 
700 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  22.34 
 
 
581 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23.21 
 
 
524 aa  78.2  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  22.35 
 
 
569 aa  74.7  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.92 
 
 
508 aa  73.9  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  34.45 
 
 
679 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  21.32 
 
 
544 aa  70.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  23.1 
 
 
492 aa  70.5  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  31.09 
 
 
591 aa  70.5  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  24.5 
 
 
709 aa  70.5  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.05 
 
 
559 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  25.29 
 
 
497 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  30 
 
 
709 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  32.61 
 
 
559 aa  69.3  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  22.87 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  24.71 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  22.1 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  33.33 
 
 
599 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  28.4 
 
 
605 aa  67.8  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  22.15 
 
 
592 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  20 
 
 
591 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  23.64 
 
 
575 aa  66.6  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  29.41 
 
 
623 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.03 
 
 
564 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  22.79 
 
 
531 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  29.6 
 
 
427 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  23.65 
 
 
524 aa  65.1  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  23.06 
 
 
550 aa  64.3  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  30.51 
 
 
520 aa  63.9  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.54 
 
 
611 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  23.27 
 
 
524 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  24.23 
 
 
496 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  19.81 
 
 
510 aa  63.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  33.05 
 
 
662 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  26.54 
 
 
608 aa  62  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  35.65 
 
 
626 aa  61.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  26.2 
 
 
700 aa  61.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  25.31 
 
 
616 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  31.71 
 
 
570 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  20.22 
 
 
589 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  33.05 
 
 
679 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  33.05 
 
 
693 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  29.75 
 
 
593 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  21.66 
 
 
579 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  37.23 
 
 
577 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  27.91 
 
 
583 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  32.74 
 
 
674 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  22.17 
 
 
537 aa  57.8  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  26.57 
 
 
617 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  25.68 
 
 
594 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  27.07 
 
 
583 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  31.2 
 
 
612 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  30.46 
 
 
625 aa  57.4  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  24.56 
 
 
643 aa  57  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  22.9 
 
 
587 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  21.96 
 
 
628 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  26.32 
 
 
584 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  21.86 
 
 
526 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  27.63 
 
 
600 aa  56.6  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  23.06 
 
 
499 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  21 
 
 
582 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  32.61 
 
 
574 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  20.28 
 
 
579 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  25.9 
 
 
783 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  27.13 
 
 
583 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  24.43 
 
 
674 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>