81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0691 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  59.15 
 
 		 708 aa  806    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1434    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1954  hypothetical protein  76.67 
 
 		 343 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.302957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  25 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  25.79 
 
 		 540 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  24.21 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  21.53 
 
 		 493 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  26.23 
 
 		 581 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  21.18 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  25.71 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  24.72 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  24.09 
 
 		 530 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  22.73 
 
 		 530 aa  67  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  21.68 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  22.73 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  20.5 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  24.43 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  21.17 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  22.73 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  24.53 
 
 		 542 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  30.23 
 
 		 700 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  23.61 
 
 		 564 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3942  hypothetical protein  30.25 
 
 		 721 aa  62  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.222103  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  24.05 
 
 		 499 aa  62  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  34.51 
 
 		 709 aa  60.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  23.67 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  23.82 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7314  hypothetical protein  33.59 
 
 		 699 aa  57.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00058158  hitchhiker  0.000000228931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  23.3 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2277  hypothetical protein  24.22 
 
 		 653 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1619  hypothetical protein  23.7 
 
 		 721 aa  56.2  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4804  hypothetical protein  29.38 
 
 		 670 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  21.98 
 
 		 508 aa  55.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.38 
 
 		 531 aa  54.7  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  28.57 
 
 		 550 aa  54.3  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  26.98 
 
 		 607 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  21.67 
 
 		 539 aa  54.3  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  25.97 
 
 		 670 aa  53.9  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  29.73 
 
 		 623 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  30.89 
 
 		 520 aa  53.5  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0408  hypothetical protein  29.37 
 
 		 657 aa  52  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.54792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  31.25 
 
 		 599 aa  52  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  26.58 
 
 		 601 aa  51.6  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  22.37 
 
 		 496 aa  51.6  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  26.35 
 
 		 659 aa  51.2  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  29.81 
 
 		 603 aa  50.8  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1476  hypothetical protein  23.9 
 
 		 670 aa  50.8  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.217881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  22.68 
 
 		 557 aa  50.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  23.91 
 
 		 534 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.28 
 
 		 524 aa  50.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  31.43 
 
 		 574 aa  50.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  36.05 
 
 		 396 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  21.7 
 
 		 510 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  22.35 
 
 		 572 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  25.37 
 
 		 524 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  28.02 
 
 		 569 aa  48.9  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  31.11 
 
 		 575 aa  48.5  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  25.31 
 
 		 595 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  27.27 
 
 		 651 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  21.57 
 
 		 559 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.34 
 
 		 560 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0611  ATPase-like protein  22.94 
 
 		 618 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  30.59 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  22.47 
 
 		 589 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  28.03 
 
 		 553 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  27.52 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  25.84 
 
 		 643 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  24.8 
 
 		 709 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  26.09 
 
 		 570 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  31.9 
 
 		 526 aa  45.8  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  25.22 
 
 		 581 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  28.19 
 
 		 744 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  30.43 
 
 		 557 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  31.4 
 
 		 523 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  25.9 
 
 		 605 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  21.31 
 
 		 569 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  22.73 
 
 		 579 aa  44.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  20.83 
 
 		 569 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.83 
 
 		 591 aa  43.9  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  26.76 
 
 		 679 aa  43.9  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  25.81 
 
 		 523 aa  43.9  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>